等董率得宜，赏之。三月，从罗博瓦峰下北剿，克得斯东寨。夜有贼七、八百人乘雪雾潜登山，犯副将常禄保营。福康安闻枪声，念以兵援，击贼退；上嘉之。五月，贼雨中于山坡立两碉，福康安夜率兵八百冒雨毁垣入，杀数贼，立毁碉。上嘉其壮兵威而破贼胆，特旨褒奖。寻夺喇穆喇穆山口木城后石卡二。六月，克色淜普山，获坚碉数十，歼贼数百。阿桂令领队额森特夜进兵攻色淜普南山碉，福康安为应；视海兰察兵登山巅，并力助战。天明，望海兰察至碉下，疾驱众，越重濠过，冒枪石与贼持，使不得他顾；我兵遂得尽破喇穆喇穆碉卡，取日则了口。七月，克嘉德古碉。■〈石文〉逊尔克宗西北寨有贼数十潜袭我兵后，福康安击退之。贼既困于围内，且以距勒乌围近，恐破其巢也，数夜出侵木城炮台；福康安屡败之。阿桂以贼死守险隘，改道由日尔巴当噶路入；令福康安攻达尔札克山下各碉，克之。十一月，攻格鲁克古，率兵裹粮，夜踰沟攀崖上，从山罅入，取当噶海寨陡乌。当噶大碉压桑噶斯玛特，取其木城、石卡。四十年三月，克勒吉尔博寨战碉二；贼从噶尔丹寺来援，败之。四月，阿桂分兵一千，令福康安从参赞海兰察赴宜喜军，先取甲索，进攻得楞山下临河贼碉；拔石卡三，又焚萨克萨榖大小寨数百，渡河取斯年木咱尔、斯聂斯罗市二寨。上以福康安西路得力之人，调宜喜攻剿尤为出力，授为内大臣。五月，克荣噶尔博山，进至第七峰；赏「嘉勇巴图鲁」号。六月，于第七峰下冒枪石成木栅九，接第八峰麓；贼恃险拒守，攻未克。七月，从舍图往卡绕截；大兵进至章噶，福康安偕额森特攻巴木图，登直古脑山，拔木城、碉寨五十，焚冷角寺，下压勒乌围贼巢。八月既望夜半，分兵自西北攻入，破其寨，据之；遂克勒乌围。九月，整兵直攻噶拉依。初从达思里正路；贼觉，改由达乌围。分队七，福康安领第一队，夺达沙布果碉当噶克底、绰尔丹诸寨；又从达思里下起木栅，断科思果木与雅玛朋所通路。十月，攻达噶木；率左右兵绕出，克坚碉二。闰十月，从阿穰曲下登前峰，克大碉、木城各二十。十一月，攻奔布鲁木护起寨，兵攻入碉，洞其垣，掷火焚之，贼无得脱者；又克舍勒图祖鲁旁碉一、寨二，格什格章寨一，萨尔歪碉寨三，阿结占寨二。十二月攻科布曲正梁，由左进攻其炮卡，遂尽得科布曲寨，贼又于布哈尔下积木中潜伏以拒，福康安从海兰察攻破之，悉取诸寨，据噶占。四十一年正月，克舍齐、雍中两寺；自拉古尔河围噶拉依之右，夺大石卡二；移炮击其寨，首逆就缚。金川平，封福康安为三等嘉勇男；其原袭云骑尉，以福隆安次子丰伸果尔敏袭。命献俘馘；上幸良乡城南，行郊劳礼。赐御用鞍辔马一；御紫光阁饮，至赏缎十二端、银五百两。阁上绘像，列前五十功臣；御制赞曰：『代兄以往，继父而奋；矜许廑励，王臣之荩。登碉夺砦，那须蒙甲；「嘉勇」锡名，世传勳业』。转户部左侍郎。四月，擢镶白旗蒙古都统。七月，赏戴双眼花翎。九月，调正白旗满洲都统。十月，赐紫禁城骑马。
四十二年，授吉林将军。四十三年，调盛京将军。
四十五年，授云贵总督。寻奏：『铜厂立法宜详，用人尤要应实。稽查各厂专理、兼理官任事后所得铜数，以凭甄别。初试者，必察其贪廉勤惰，用定劝惩；以冀厂内多一得力之人，即于将来铜政有裨。至私钱毁于既行之后，尤须禁于未铸之先。私铸黑白，利在多铅、少铜；滇省前禁私铜、未禁私铅，是以奸民于附近铅厂卖鬻私铅，易滋私铸。若铅、铜于官给印券通商，额铅外有券外夹带及无券之铅，严禁无漏；则奸民无利可图，势将日止』。又奏：『滇铜多为开釆以裕其源，无庸加价』。皆从之。四十六年七月，南掌国贡象四，复陈交趾等国劫掠无御敌器，以余象一求予炮；福康安檄谕以「国家法制有定，不容妄求」，还其象，不予之炮。奏入，上是之。
八月，调四川总督兼署成都将军，命严缉■〈口固〉匪。四十七年五月，奏蜀中匪徒已戢，陈善后事：保甲则量户口、地址，立法清厘；匪犯则并父兄、牌甲，各予治罪；窝家严缉查拏，赌博倍加禁戢；僧道、佣贩、乞丐、流民，分别稽查递籍；铜铅矿厂水手、桡夫，各有责成约束；严禁持造凶刀，停止海查兵役；讲「圣谕广训」并钦奉上谕、律例，冀使返朴还淳，潜消暴戾；「■〈口固〉匪」字本无意义，留此名色转难示儆，请改为「川省匪徒」，恶名既已消除，匪迹自无蹈袭。从之。八月，擢御前大臣，加太子太保。
四十八年四月，命来京，署工部尚书。五月，授总管銮仪卫大臣、阅兵大臣，总管健锐营事务。十二月，命驰驿往广东查盐商公捐费买物修贡事。四十九年三月，奏商人所备贡物，俟一、二年商人充裕，督臣代进；洋商修物，监督代进。谕曰：『商人等领帑经运交课，不过微末之人，原不得非分进贡。福康安所奏督臣代进，竟应议驳；洋商与盐行无异，断不可行』。闰三月，擢兵部尚书、总管内务府大臣。
四月，甘肃逆回田五等私起新教，聚众滋事；上命福康安带「钦差大臣」关防，驰驿往剿。五月，授参赞大臣，同将军阿桂会剿。是月，授陕甘总督。六月，