康熙十三年七月丁卯，命提督张勇严饬边防。上谕张勇曰：边陲重地，恐奸宄窃发。卿乃封疆大臣，朕所简任，可率所属总兵等官固守地方；有妄行为乱者，严行缉治，以副朕倚任股肱之意。
癸酉，命江南绿旗兵习水战于黄浦江。先是，将军王之鼎疏称：耿逆潜通海寇，煽乱地方；沿江沿海，亟宜熟筹剿御。请于崇明沙船一百艘留三十以备巡逻，余尽泊黄浦江；遣满洲汉军兵配绿旗兵操演，以备策应。奏入，上敕将军阿密达等公议酌行。既阿密达等疏称：江南松江黄浦一带，现无警息。若拨满洲汉军往驻，则沿途百姓有供亿之累；派取民房居住，则土著之民有失业之虞。请止拨绿旗官兵不时练习。若黄浦江诸处有警，相机应援。上允之。
命大将军贝勒洞鄂等各率所部速进四川。经略莫洛奏言：大兵在保宁与贼相持，恐运馈日久，秦民必致疲苦。臣今亲赴汉中，酌量分路进发；贝勒洞鄂等若率众尽行，虑致迟滞。请敕贝勒洞鄂以所将骁骑并入康亲王军内，自率所部轻骑赴西安，旋进四川。上谕：洞鄂部下无多，所将骁骑既入康亲王军内，轻骑入川，兵力单薄；可令贝子、公等亦各率所部轻骑并力前进。
杨富谋叛，伏诛。时南瑞总兵官杨富隐匿在官盔甲、私置竹炮器械，暗招闽兵千余练习滚牌；与贼潜通，谋为内应。江西巡抚董卫国与将军希尔根等密商，于是月十一日以计擒之，实时伏诛。
乙亥，命将军希尔根等固守赣州、袁州。先是，巡抚董卫国奏：闽贼出犯杉关，新城失守。至是，又奏：贼攻破石城，声犯宁都。上谕：赣州乃入粤孔道，将军希尔根、巡抚董卫国等务会同商酌固守之策，并趣副都统干都海、署副都统公沃赫等速赴江西。复谕兵部：袁州与湖广接界，亦属要区；可令将军希尔根、哈尔噶齐、根特巴图鲁等，协心商酌守御之策，务期保固。寻以袁州副将赵应奎为袁临总兵官，驻防袁州。
丙子，命副都统喇哈领速赴衢州。总督李之芳疏奏：贼兵合力来犯衢州，臣标兵单可虞；请敕副都统拉哈统兵亟进，以壮声援。上谕：拉哈兵不必留驻杭州，速赴衢州与将军赖塔并力剿御；将军拉哈达、侍郎达都、副都统玛哈达、雅塔里等仍驻杭州防守。副都统吉勒塔布之兵，视何处警急，即往应援。
戊寅，命平南王尚可喜等备交趾。总督金光祖奏：交趾知孙延龄叛逆，乘机蠢动，陈兵边界，其情叵测；请加防御。上敕平南王及总督、提督等严饬边将，不时侦察，仍增官兵防守险隘。
壬午，命副都统伯穆赫林率喀喇沁土默特兵速赴浙江。先是，上命副都统苏朗、署副都统额思赫率蒙古兵二千之江宁，即留付将军阿密达，令之驻防；其原驻江宁喀喇沁土默特兵，令苏朗等率赴浙江。至是，浙江贼寇蜂起，衢州告警；将军拉哈达奏闻。上谕：衢州正在危急，令副都统伯穆赫林率喀喇沁土默特兵自江宁速赴浙江，与将军拉哈达等会同剿御；副都统苏朗等仍率蒙古兵镇守江宁。将军拉哈达、赖塔、侍郎达都、总督李之芳既同任剿抚之事，一应军务，须共同商确，毋分彼此。如浙地何处有警，即相机应援。
命平南王尚可喜等固守梧江诸处。总督金光祖奏：梧州失陷，我兵据守梧江。上谕：将军根特巴图鲁等兵由袁州取长沙，进广西以袭贼后；则取道广东，必致迟久。可令平南王尚可喜、总督金光祖、提督马雄会同酌议，添发官兵规取梧州；否则，固守梧江诸处，相机剿御。
命经略莫洛等措置进川官兵机宜。将军瓦尔喀等奏：征四川总兵官王怀忠标兵因饷匮逃散，今欲剿贼，兵力单薄，运馈不至；乞发兵救援。上谕：康亲王杰书及贝子准达所部骁骑，俱令贝勒洞鄂率之以行。其大兵或仍据壕堑围守保宁、或因粮运艰难暂还广元，命经略莫洛、将军瓦尔喀等公同商酌。王怀忠标下逃兵，姑宽其罪；应如何抚纳，亦令莫洛商酌速行。
丁亥，大将军顺承郡王勒尔锦奏，官兵败贼于岳州。是月十一日，贝勒察尼、将军尼雅翰等分部满、汉官兵水陆齐发，进攻岳州。伪将军吴应麒等率贼七万余，列鹿角、牌铳，陆路相拒；我兵奋击，大败之，斩首万级。舟师抵七里山，以炮攻贼，沈其船十余艘。
己丑，大将军康亲王杰书帅师之浙江、大将军贝勒洞鄂帅师之四川。先是，杰书奉命征讨，候调蒙古兵到同发。至是，杰书奏；浙江告急，宜速往援，若俟蒙古兵同行，恐稽时日；请率兵先往。上遂命于是日启行。洞鄂亦同日率兵之四川。
辛卯，诏收葬耿精忠祖父骸骨。上谕兵部：耿精忠虽背恩反叛，其祖父投诚效力，累世旧勋，朕岂以精忠之罪，及其先人。大兵平定闽省之日，其祖父骸骨，仍许收葬。
八月癸已，命给大将军等分兵印信。上谕兵部：诸路大将军止各给一印，倘分兵赴剿别无印信，则招抚贼寇、宣谕百姓及调遣防守地方两军移会机宜，何以为凭？其再给大将军顺承郡王勒尔锦印二。至大将军康亲王杰书处有将军赖塔印一，再给印一。大将军贝勒尚善处有将军尼雅翰印一