兵移镇德州，总监太监高起潜以兵驻临清、济宁。时学朱按章邱，济南告急，学朱驰会城坚守。明年正月，城陷，学朱及巡道周之训死之；长子德宽遍求遗骸不获。起潜既不援济南，又以失藩王故，恐被诛，谋卸罪于学朱；而中朝忌学朱者，遂诬学朱不死。次子德宜伏阙上书，略谓『臣父衔命巡方，本无兵权，犹慷慨身任守城，卒以死殉。泣念臣父孑身蒙难，非若守土之官携有亲属收殓，致使形销骨化，无榇可还。惟冀上邀君恩，稍光泉壤；而详核再三，尚缺题恤。臣若隐忍，何以为人？复何以为子』？有旨：『察议』。给事中光时亨上疏，力白学朱被诬状；刑部尚书徐石麟等三百有四人复公言于朝，吏部左侍郎沈惟炳亦请与恤核，而议终不决。至是，赠荫。
二十一日（丙午）
称福恭王陵曰熙陵。
谕刑部速定从逆诸臣罪案云：『所据从逆诸臣，如领兵献策，即在庶僚，岂可末减？总兵督抚降贼，情罪极重，岂可列诸二等？京卿科道翰林，受贼伪命，岂止于一绞？封疆大吏，闻变倡逃，岂止于流？献女献婢，岂止于徒？诸臣负恩辱国，至此须有定案，昭示天下』。
马士英以河南巡按陈潜夫私自回籍，传旨命浙江抚按察明。
彭遇颽避乱南渡，首附马士英，怪论蜂起；授职方主事。
安远侯柳昌祚乞侍经筵。
二十五日（庚戌）
开佐工事例。
文华殿中书一千五百两，武英殿中书九百两，内阁中书二千两，翰林院待诏三千两，找贡一千两，推知衔一千两，监纪职方万千不等。
时语云：『中书随地有，翰林满街走；监纪多似羊，职方贱如狗。荫起千年尘，拔贡一呈首。扫尽江南钱，填塞马家口』。
二十六日（辛亥）
停宗室换授。
革侍郎吕大器职。马士英憾大器未已，令太常少卿李沾劾之，遂削籍。复命法司逮治大器，以蜀地尽失，无可踪迹而止。
大器致仕谢表有云：『铜马、赤眉、突厥、兀术合奏而糜烂神州，永嘉、靖康、温敦、秦贾接踵而横据津要』。故马、阮衔之刺骨。
礼科都给事中沈胤培为祖、父请谥，谥沈子木「恭靖」、沈儆玠「襄敏」（子木，归安人，官南京右都御史；儆玠，字叔永，官南京工部尚书）。
左懋第等至天津，原任锦衣骆养性为大清巡抚，遣兵相迎。至杨村，土人曹逊、金镳、孙正强谒见，言报国之志；懋第署以参谋。至河西，务（？）赞画王言賷二人名帖送内院；冯铨、谢升等词色俱薄，却帖不收。
予大学士孔贞运谥「文忠」。
总兵卜从善移驻芜湖。
命李世春驻泗州、贺胤昌驻扬州，俱充总兵官。
二十七日（壬子）
再命刑部逮问黄澍。
夺黄鸣俊官，逮问前巡按御史左光先。初，马士英荐阮大铖，光先力争不可；大铖修隙，与姚孙棐并逮。光先匿左良玉所，缇骑不敢赴，乃止（光先，光斗弟也；故大铖尤恶之）。
以处分许都余党未定，故罢巡抚黄鸣俊并降巡按任天成；核孙榘贪酷，激变地方，故逮孙榘，并议光先，令在朝浙臣具奏情形。光先在浙，风裁清卓；马、阮以光斗弟故，借事陷之，朝右无敢为直言者。苏松巡抚祁彪佳独言：『许都之变，突发于东阳，义鸟、浦江皆无坚城；光先竣事出境，闻变遄还。抚军悬阙，一切调兵措饷，皆其宵且拮据。变起不一月，元凶授首，两浙危而复安；乃今奉旨推求！夫弄兵揭竿，至于破城据邑，其罪岂不当死？当日兵威所迫，贼已穷蹙而后乞命，与阵擒无异，非诱降也。设诛锄不力，养虎贻患，后来国难方张，又不知作何举动矣！岂可反以激变罪之乎』？于是士英、大铖并切齿彪佳。降旨：『左光先力庇贪令，流毒东越；着与东阳知县姚孙榘一并革职提问』。
按东阳民变，始于横派之酷、成于屠掠之惨；许都罪固当诛，孙榘贪亦应黜。乃光先悉斩许都同党，而贪酷之令、无纪之兵置之不问，宜余党之复乱也。卒之马、阮借题报复，公论出之仇口；有以哉！
升黄道周礼部尚书，协理詹事府事。
补荫故都御史沈子木一子入监。
颖州生员卢鸿上「七政历」。
追谥焦竑「文端」、陈仁锡「文庄」，并赠詹事。
谥张文纪「文懿」、董其昌「文敏」、何如宠「文端」。
吏科熊汝霖疏言：『献贼现据成都等郡、闯贼将至成都，意在顺流东下；北使诸臣所恃为缓清之要着，全赖左懋第一人。臣思诸兵请饷，望眼尚悬；而燮敕印未颁，马价未给。此何时也，而尚容姑待乎』？
浙江奉化布衣方翼明疏，指摘马士英等；有旨：『发刑部问罪』。
淮扬巡抚田仰疏为刘泽清请饷；有旨：『东南饷额不满五百万，江北已给