忠起，相继陷诸州；明兵数失利，京师大震（明史）。郑鸿逵中庚午武举，隶都督孙应龙麾下。登莱之役，应龙败绩，逮系天津；事白，以芝龙平红夷功移荫锦衣卫千户，中庚辰武进土。是岁为福建副总兵（郑成功传），设南赣兵三千统之（明史纪事本末）。
正保元年甲申（明崇祯十七年、清顺治元年），正月，前兵科给事曾应遴荐鸿逵曰：「缓急可用」；诏益兵二千，令以舟师守镇江。二月，议京师城守，诏天下勤王。三月，封宁远总兵官吴三桂为平西伯（明史。「平西」二字据三朝实录），飞檄召三桂入关（明纪编年）。贼先入关，京营兵溃，城陷，明主殂于万岁山（明史）。自成僭称帝，国号「顺」。既而三桂率兵入援（明纪编年）；贼遣人招三桂，三桂不从。时清主章帝令其摄政和睿亲王多尔衮为将军，伐明。三桂致书求援，多尔衮许之；且曰：「率众来归，封以故土，晋为藩王」。三桂复致书，约以首尾夹攻。多尔衮星夜进发，至山海关，三桂降于清；与清兵合击，大败贼。五月，多尔衮与三桂共捣北京，明臣民迎降（三朝实录）。
福王名由崧，神宗孙、庄烈帝之兄也。避乱南下，凤阳总督马士英、兵部尚书史可法等迎而至南京；是月即位（明史稿），称明年为弘光元年（明纪编年、三藩纪事、中兴实录）。史可法等为东阁大学士，入阁办事；马士英加太子太师，处军务；总兵鸿逵镇九江、黄蜚镇京口。诏令黄斌卿防御京口，调芝龙兵六千入卫。八月，张献忠陷成都。封芝龙南安伯。九月，鸿逵移屯镇江（明史）。十月，章帝即位，奠鼎燕京，国仍号清，建元仍顺治（三朝实录）。芝龙以总兵镇守福建（明史）。
二年乙酉（福王弘光元年、唐王隆武元年、鲁王监国未称元、清顺治二年），正月，福王在南京（明史稿）。四月，左良玉举兵，称除君侧恶，将讨马士英，适病死，子梦庚东下，至采石战败；赏功，赐总兵郑彩等银币有差（明纪编年。「总兵」二字据三藩纪事。按明遗民张斐曰：「举兵者梦庚，非良玉」；然则编年说得实，明史稿为父子分兵陷州县者盖讹，故不取焉。按彩，盖芝龙亲族也，然不详其系；华夷变态以彩为成功一名者，误矣）。清兵破扬州，史可法等死之（明史）。五月，封鸿逵靖卤伯。清兵进至扬子江；水师总兵鸿逵、彩等督兵守江，杨文骢监军。清兵以大炮击，每炮发，江水涌激数丈。二帅见势不可为，遁去。清兵乘烟雾蔽江，缚刍置木筏上，张灯顺流以下，绐京口兵；京口兵以为真兵，悉尽铳丸，而清兵潜从龙潭渡逼都城。王遁至芜湖，中军田雄挟王降清（参取明史、明纪编年、明史纪事本末、三藩纪事、三朝实录、华夷变态。按明清斗记曰：「芝龙装士兵一千为日本人，令持火器，芝豹领之，遣鸿逵阵，临江发大小铳御之，清兵死伤无算；清人患之，谋设藁人，尽其火药，然后得涉江」）。王践位无几，盛兴土木，荒酒渔色，侈费无度。刘宗周、陈子龙等上疏极谏，不听；识者豫知其不堪旦夕矣（参取明史、三藩纪事）。
唐王名聿键，端王硕熿孙也。南都失守，王避乱来闽；时彩、鸿逵亦彻师回闽，因奉之至福州，与张肯堂、吴春枝、黄道周及芝龙等会议，立王监国。时拥入徒艳翊戴功，咸请正位。诸大臣多言监国名正，出关尺寸，建号未迟；芝龙意别有在，亦固争以为不可。惟鸿逵请正位，曰：「不正位，无以餍众心以杜后起」；遂定议。闰六月，奉王即皇帝位于福州，改元隆武（参取明史稿、明纪编年、三藩纪事、明季遗闻）。封芝龙为平卤侯、鸿逵定西侯（三藩纪事。粤游见闻，「定西」作「定虏」），俱加太师（郑成功传）；以按察司为芝龙第。拜鸿逵为大将军，择吉授钺。至期，大风雨，登坛时，所悬匾飘坠中钺，柄折为二（粤游见闻）。芝豹为澄济伯（三藩纪事、郑成功传）、彩永胜伯（三藩纪事），彩弟联都督总兵（明季文字。书「彩弟」，据郑成功传）。设六部九卿。蒋德璟等为大学士，入阁办事。令万元吉、杨廷麟守赣州；措置有方，营行宫，累疏将迎车驾，芝龙阻而不报（粤游见闻）。芝龙荐曾樱为工部尚书、东阁大学士，鸿逵荐杨文骢为兵部侍郎（明史）。时文武济济，然兵饷、战守芝龙悉为政。八月，芝龙集廷臣议战守，定兵二十万：自仙霞关以外宜守者一百七十处，每处多寡不齐，约兵十万；其余十万充战兵精练，而明春将出关。合闽、浙、两粤之饷，不足供兵食（明史稿、明纪编年、明史纪事本末、明季遗闻）；芝龙遣给事中梁应奇入广督饷（明季遗闻），且令抚按以下捐俸助饷（明纪编年、明史纪事本末）。芝龙幼习海，知海情，凡海盗皆故盟或出门下。自就抚后，海舶不得郑氏令旗不能往来。每一舶，例入三千金，岁以千万计，以此其富敌国。府第安平镇去泉州城南三十里，后筑城于安平镇，舳舻直通卧内。所部兵自给饷，不取于官，旗帜鲜明，戈甲坚利，其徒卒竞劝；凡贼遁入海者，檄付芝龙，取之如寄。故郑氏之势，振于七闽矣（明纪编年、郑成功传、明季遗闻）。隆武尚未有嗣（明纪编年），芝龙见成功于隆武（三藩纪事）。隆武伟而抚其背曰：「惜无一女配卿！卿当尽忠吾家