為。皆不稱意。當知悉是過去已來。惡業遺報所致。是故今當勤求懺悔。懺悔人間惡夢惡相諸不吉祥之報。懺悔人間惡病。連年累月不瘥。枕臥牀席。不能起居之報。懺悔人間冬瘟夏疫。毒癘傷寒之報。懺悔人間水火盜賊。刀兵危險之報。懺悔人間為被獅子虎狼毒蛇惡蝎蜈蚣蚰蜒。害人之報。懺悔人間生老病死。憂愁苦惱之報。懺悔眾生身語意業。造作增長種種惡業之報。懺悔眾生當墮三惡趣中。無量千歲受諸劇苦之報。懺悔眾生應以地獄傍生鬼趣。流轉無窮之報。懺悔眾生不復更生諸餘惡趣之報。懺悔眾生為人奴婢。受他驅役之報。懺悔眾生或作牛馬駝驢。恒被鞭撻之報又常負重隨路而行。飢渴逼惱之報。懺悔人間厭魅蠱毒。飛屍邪鬼。偽作妖異之報。如是現在未來人天之中。無量禍橫。災疫死難衰惱之報。(眾等)今日至誠向藥師佛。海會聖眾。求哀懺悔。願皆消滅。前已究竟。是病是藥。同歸一幻。惡業所致。一切報障。今當次第。發願回向。(某)等願以此懺悔三障所生功德。悉皆回向。施與一切眾生。俱同懺悔。願與一切眾生。從今以去。乃至菩提。念生死苦。發菩提心。改惡修善。返邪歸正。身心安樂。妙算無窮。衣食豐饒。家屬資具。倉庫盈溢。形相端正。聰明智慧。勇健威猛。諸將擁護。佛聖匡扶。凡所施為。悉希。
  慈蔭。弟子(某)等。又願從今以去。速證菩提。相好光明。莊嚴殊勝。願諸眾生。蒙光開曉。隨意所趣。作諸事業。願諸眾生皆得無盡。所受用物。無所乏少。願諸眾生建立大乘。悉令安住菩提道中。願諸眾生得不缺戒。設有毀犯。還得清淨。願諸眾生端正黜慧。諸根完具。無諸疾苦。願諸眾生眾病悉除。家屬資具。悉皆豐足。願諸眾生轉女成男。具丈夫相。乃至菩提。願諸眾生出魔羅網。解脫一切外道纏縛。願諸眾生王法所加。悲愁煎逼。皆得解脫。願諸眾生飲食飽足。後以法味。畢竟安樂。願諸眾生如其所好。種種衣服。隨心滿足。願諸眾生長壽富饒。官位男女。凡有所求。一切皆遂。令諸世界。百怪九橫。八難三災。他國侵擾。盜賊反亂。一切惡難。盡皆消滅。國界安隱。風雨順時。穀稼成熟。一切有情。無病歡樂。菩提行願。念念增明。救苦眾生。常如己想。又願生生世世。在在處處。不墮邊鄙。生正信家。相貌端嚴。智慧辯才。遠離惡法。親近善友。堅持律行。安立大乘。又願生生世世。在在處處。興顯佛法。破諸魔網。奮志滿修六波羅蜜。廣修供養。福慧莊嚴。忍辱精進。證菩提道。我等今日。應當念報。
  藥師琉璃光如來恩德。常應如是利益安樂一切有情。是故志心。歸命頂禮。
  南無薄伽伐帝。[鞥-合+(白-日+田)]殺社。窶嚕薜琉璃。鉢囉婆。喝喇闍也。怛他揭哆耶。阿囉訶帝。三藐三勃陀野。怛姪他。唵。[鞥-合+(白-日+田)]殺逝。[鞥-合+(白-日+田)]殺逝。[鞥-合+(白-日+田)]殺社。三沒揭帝莎訶
  東方端坐。無上醫王。十二大願妙難量。滅罪殄災殃。降福垂祥。增益壽綿長。
  藥師佛  藥師佛  消災延壽藥師佛  南無消災延壽藥師佛
  (如前起佛偈遶壇念佛迴向)

  消災延壽藥師懺法卷中
  消災延壽藥師懺法卷下

  佛身充滿於法界  普現一切眾生前  隨緣赴感靡不周  而恒處此菩提座
  三世諸佛。愍念眾生。為說藥師道場懺法。今當歸命。一切諸佛。
  南無毗盧遮那佛  南無本師釋迦牟尼佛  南無藥師琉璃光如來  南無無量壽佛  南無盡十方遍法界過去一切諸佛  南無盡十方遍法界現在一切諸佛  南無盡十方遍法界未來一切諸佛  南無藥師琉璃光如來本願功德經  南無日光遍照菩薩  南無月光遍照菩薩  南無文殊師利菩薩  南無觀世音菩薩  南無得大勢菩薩  南無無盡意菩薩  南無寶曇華菩薩  南無藥王菩薩  南無藥上菩薩  南無彌勒菩薩  南無消災障菩薩  南無增福壽菩薩  南無樂音樹下三萬六千菩薩  南無阿難尊者八千比丘諸大聖僧  南無救脫菩薩
  禮諸佛已。次復懺悔。弟子(某)等。上來既懺悔已。應生無垢濁心。無怒害心。於一切有情。起利益安樂慈悲喜捨平等之心。於是斂念正觀。不斷結使。不住使海。觀一切法空。如實相。云何名觀一切法空。行者諦觀。現在一心。妄心隨所緣起如此之心。為因心故心。為不因心故。為亦因心。亦不因心故心。為非因心。非不因心故心。為在三世。為在內外中間。有何足跡。在何方所。如是等種種因緣中。求心畢竟不可得。如夢如幻。無名無相。爾時行者。尚不見心是生死。豈見心是涅槃。既不得所觀。亦不得能觀。不取不捨。不依不着。亦不住寂然。言語道斷。不可宣說。觀心無心。則罪福無主。罪福性空。則一切法皆空。心無所心。法不住法。作是懺悔。名大懺悔。名破壞心識懺悔。以是因緣。心心寂滅。念念無住。如太虗空。虗空亦不可得。究竟不可得。亦不可得。自然超諸三昧。光明照耀。萬法顯現。通達無礙。廣大如法性。究竟如虗空。惟願得如所願。滿菩提願。眾等各各運心。歸命