程、朱为宗；黜异端，崇孔氏。以之祔祀学宫，洵为不愧』。下部议行。二十四年，遵谕保奏知府倪良耀、麟桂、吴式芬、知州周玉衡、同知程灿策、知县曹士桂等，报闻。二十五年，奏拏获青莲教匪戴理钊、古魁连等，论如律。二十七年四月，以御史朱昌颐奏陈漕务积弊、请将帮弁及地方诸费明定章程，给事中雷以诚奏请裁减旗丁津贴各款，均遵旨议覆；疏言：『查江西粮额较轻，津贴亦少。嘉庆年间，迭次将旗丁各项陋规十五款分别裁革。近年复严切查禁，并无踵事加增，官民亦属相安。今若将帮丁及地方诸费明立章程，是以本非例给之银、额定之项，一一悬为令甲，不特事多窒碍，抑且迹类加征。在昔申明例禁，犹虑不肖之员暗中需索；若令明定章程，更恐有所影射，例外浮加。与其纷更而事有未便，不若循旧而察核从严』。从之。十月，拏获南、赣等府会匪谢词封等九十三名，治罪如律。
二十八年六月，调浙江巡抚。七月，由玉山县行抵浙江衢州，访闻衢州镇标左营游击薛思齐有借端讹索商旅情事；八月，抵任，即奏褫薛思齐职，遣戍新疆。又甄劾署归安县知县李玉典等五员，分别降革、休致；均允行。九月，以浙江各厅、州、县有七十七缺多系署事之员，奏言『此中纷纷调署，甚有一员递署他缺二、三处久不回本缺者，有卸署后不回本缺闲住省垣者；以致交代之案愈积愈多，辗转不能算结。且官无定所，即政难考成。见在访司分别核办，勒回本缺；或不堪回任者，即令揭参。其实系空缺及要地需才，亦祇准专员署理，不得纷纷更调，以专责成』。又各府、州、县一书院掌教多至数人，幕友中并有书启、征收号件等名色，每年支取干修，其实均不到馆。上司循绅士、游客之请，荐之属员，属员勉为酬应；而其中苍猾之员，即隐以此挟制上司，借口赔累，亏库项、求调济，弊端不可胜言：请严檄通行禁绝。疏入，上嘉勉之。十一月，以核办清查需人，奏请简派户部保列一等司员赴浙帮同钩稽；上以向无此例，不许，仍责成文镕遴选妥员核实办理。二十九年正月，以本籍水灾捐银备赈，下部优叙。闰四月，偕钦差仓场侍郎季芝昌清查浙江盐务，奏筹变通章程：『一、杭、嘉、绍三所引盐分别加斤，止令完正课；一、松所引盐，酌裁科则；一、虚悬口岸，选商接办，并筹款收盐；一、缉私责成官商，由运司审核；一、缉获私盐，分别充赏及补催作正配销；一、禁革引地陋规；一、核裁巡验浮费』。五月，偕闽浙总督刘韵珂奏「督剿渔山盗百余人，置诸法；沈毁盗船，并将巢穴门户分别堵除」。得旨嘉奖。时浙江积歉，本年杭、嘉、湖、绍、严五府又夏潦为灾；六月，奏招商贩运台米、洋米、山东小杂粮，各海关俱免其纳税，并请拨款备赈。又请将文闱乡试展缓一月：俱允之。旋以遇灾恐惧，上疏自劾，恳求罢斥；上责其「迂腐无能，率意上渎」，严饬之，并革去顶带，暂留浙江巡抚之任。十月，捐银备浙江各属赈需并捐备江苏本籍赈需，下部优鈙。十一月，奏：『亲赴嘉、湖一带灾区查察赈务，并无冒滥遗漏。其被浸之枯桑，经七、八月后畅晴煦暖，渐次发荣。并有野蚕作茧悬缀桑颠，用以缫丝，贫民颇资接济』。报闻。三十年，文宗显皇帝御极，诏求贤才；四月，文镕奏保布政使汪本铨、按察使黄宗汉、知府余士瑮、同知毕承昭、知县段光清、杨裕深等。又以上年办赈官绅奋勉出力，奏保秀水知县江忠源等。五月，西防厅所属北岸石塘以潦盛潮涨，决口六十余丈；文镕闻报，即往勘。时风雨交加，沿岸草松泥滑，文镕失足落水，几濒于危；以救免。寻以未能先事豫防，自请治罪；得旨：革职留任。嗣于六月力疾驻工，先将柴、土各塘克期堵合，以便八月大汛后建复石塘；奏入，恩予开复。八月，杭、嘉、湖、绍等府属大雨两昼夜，江河泛涨，田庐被淹，西防厅石塘亦续塌十余丈；文镕以「饬属疏消积水，并多购料物赶筑土塘」奏闻。十月，奏「续办缺口土塘已堵合完固，并将前次所塌石塘采购石料次第建复」。谕曰：『吴文镕前后督办，尚知奋勉。所有前经革去顶带之处，着加恩赏还』。又查明各属歉灾情形，分别蠲缓，并请给口粮；如所请行。
十一月，升云贵总督。咸丰元年正月，入觐，赐紫禁城骑马。四月，抵任；谢恩疏言：『前陛辞时，蒙我皇上谆谆提撕，知臣之待人以诚，而勖臣以察伪；鉴臣之任事稍急，而诫臣以爱身：此臣所懔切书绅、时加儆省者也』。奉朱批：『汝当终身诵之』。十月，甄刻不职之知府许文■〈言受〉、知县杨玉德等四员，分别奏请勒休、改教；均允之。十二月，文山县江那地方侬匪李开甲等造言敛费，纠人焚劫；檄知县刘劭高擒治如律。奏入，上嘉其办理妥速。先是，永昌边外夷匪乘虚入边焚掠，经官军堵剿，宣抚司衔土守备左大雄复率土司各练深入搜捕；至是，迭歼匪犯七百余名，俘首从五十七名，余匪悉窜雪山以外，边境肃清。文镕奏请将在事出力员弁分别奖励；允行。时粤匪洪秀全等稔乱；二年四月，文镕以嘉庆初年剿平川、楚教匪行坚壁清野法，着有成效，录呈将军伯明亮等原议奏稿，并疏言：『此事必须府、州、县得有贤员，方能收效。倘有司不得其人，无