其专折陈奏；更奖励王德榜军，令同时并举，为刘军犄角：则规复可期矣』。八月，命在总理各国事务衙门行走；疏辞，不许。九月，以征南诸军将帅不和，多怀顾望；疏请特简一威望素重之大臣如彭玉麟等督办两省征南军务，以一事权。复奏保刑部主事扬秀实、举人知县黄遵宪，均得旨录用。十一月，疏言：『闻鸡笼失后，台湾巡抚刘铭传知为李彤恩所误，愧悔莫追，竟成心疾；章、曹诸将无所禀承，台防危急。请旨电敕杨岳斌迅速渡台，察看刘铭传：如精神识略足巩全台，即令其迅复鸡笼，以赎前过；倘病状属实，则应先解其兵柄，俾令静养，冀效将来。一面按问李彤恩挟怨失机罪状，一面严敕曹、章各军克期进取，不得迟回，致生他变』。自法、越事起，承修陈说兵事，章凡十三上；皆留览，多见采纳。十二月，左中允樊恭煦因言事降黜；承修疏乞宽免，奉严旨切责，下部议处。寻议以降三级调用，加恩改为革职留任。
十一年六月，连疏劾湖南布政使龚易图贪劣钻营、河南开归陈许道潘仕钊猥鄙刻薄、广东学政叶大焯嗜利无厌，经彭玉麟、张之洞查办得实，均罢斥。七月，请假回籍省亲；诏许之。未出都，复奉命赴南关与法使会勘中、越分界事宜。十月，驰抵龙州。时北宁谅山越团游勇充斥、道路梗阻，法使欲会于北海，从广东钦州勘起；总署巳坚拒之。承修正欲出关察看，奉电谕谓「地图法使所携有同异，当以「会典」、「通志」为主。或谓谅山在分水岭东，本宜划归粤界；惟此说与新约不符，顺费辩论。若于两界之间留出隙地若干里作为瓯脱，最属相宜」。而云贵总督岑毓英则请令法退还北圻数省，于河内、海阳通商。两广总督张之洞则谓「三不要地为历朝旧界，宜划归中华」。时议又谓法兵病、饷艰，议院欲弃北圻；宜划谅山河北驱骡为我界，谅山河以南东抵船头、西抵郎甲河以北为瓯脱。更有谓越乱方炽，法力已疲；待其技穷，方易就范：持论不一。上亦以议界必博采众说，多争一分即多得一分之利益，勿轻率从事为训。十一月，约法使浦理燮会于文渊。先是，谕旨令广西巡抚李秉衡会回履勘；法使以其握兵权也，不欲与会，坚却之。承修电奏力争，秉衡始得与议。两粤疆臣欲会议时，令冯子材、苏元春两军在粤、越界地陈兵慑制；诏止之。承修乃单骑出关，与浦使会商，坚欲照约先议改正界限；而彼则力持先勘原界之说，辩论各不相下。浦使多方恫吓，承修亦言「看界而不更正，即断我头亦不能从」；浦使知不可夺，阳许以文渊、保乐、海宁三处归我。旋又悔之，阴乃电告其驻京使臣，以承修违约争执，势将罢议；复挟其国外部电，大言耸我朝廷，肆其要挟，遂有「先勘原界、再商更正」之谕。承修复电陈三难、二害，略谓『附界居民畏法虐，不愿改隶者不下数万人；若先勘原界，民心惊疑，恐遮道攀辕，因而滋事：难一。游勇近攻得保乐，牧马以东千百为群，道路梗塞：难二。原界俱在乱山之中，十不存五。悬崖迭巘，毒瘴渐生；加之淋雨，人马不前：难三。且既勘原界，彼必扬去新界，绝无可商；岂惟驱骡，即文渊亦不可得，关门失险，战守俱难：害一。文渊已失，谅北无寸地属我；势必胁我关内通商，边营尽落后着。揖盗入门，既弃越地，复失粤地：害二』。朝廷始终中于法使先入之言，奏入不省；仍电旨催促先勘原界，所争新界暂置不论。十二年二月，春深瘴起，承修电述病状，请暂停议，回龙州医治，俟秋后再勘；上仍不允。而浦使更坚约速勘；承修再申前请，严旨诘责，有「耆英治罪成案俱在」之语，并下部严议。承修乃抉病会勘；至平而关，瘴疠更盛，法使亦病，不能前；乃互约停勘。旋奉谕：『邓承修前曾给假省亲，准其率同随员暂回广东；届期，再前往钦州起办』。是年冬十月，如约赴钦州。十一月，至那梭。时法使浦理变因事回国，别遣狄隆、海士来会。海士先至海宁，适为越团游勇所戕，越、粤道梗；十二月，狄隆始至芒街。尚未开议，法已先占江平、长山等地，盛兵相待。承修亲往会议，而狄使因海士之死，疑为粤人主使，甫晤面，即盛气相加，肆言怨愤；承修以礼折之，气稍下，始及界议。法以偏地团勇、艰于履勘，请援照云南办法，按图定界；朝廷已许之。于是首议江平、黄竹、白龙尾各地，法以为其用兵所得，不肯轻让；据无稽之图说，欲划归越境。承修以地属龙门营水师汛内所辖，居民有华、无越，中外图籍炳然，极力辩争；狄使见我词理俱直，欲权于白龙尾中画一线，左归华、右归越。承修以其它为钦、海外户，我守之则遥控海宁，敌窥我廉郡，必顾其后；若彼居之则内逼防城，外断东兴、思勒，是无钦、廉也。即中分一线，此岛形狭而长，彼既筑垒，我将安守！形势所关，不能迁就。议久未决，乃暂与定约三条：一、大段相合；二、较图不合，作为未定，各请示本国；三、撤江平之兵。狄使仍狡辩；乘界议未定，竟以兵力驱江平、黄竹居民内徙；呼吁使辕，哀求安置者日凡千百。承修责问狄使，彼答以兵事有地方主持；江、黄界已归驻京使臣与总署面议，不能搀越。反复诘驳，往来六次，两无端绪。朝廷恐议久无成、别开边衅，许驻京法使之请：「凡未定之界，归入后议