至暮，焚贼舟一百九十余艘，杀其将三百余，兵万二千有奇，遂进澎湖。时士卒数万，缺淡水，随地凿井，甘泉涌出。于是军声大振。国轩遁归台湾。克塽始决计归顺，遣伪官冯锡珪、陈梦■〈土韦〉献延平王金印一、招讨大将军金印一、公候伯将军银印五，来乞降，时七月二十七也。琅为疏请先令侍卫吴启爵持榜入台湾，谕军民薙发。乃于八月统大兵入鹿耳门。人谓郑氏、琅深仇也，将快意焉。琅曰：义不共戴，宁忍忘之。顾绝岛新附，一有诛残，恐上下疑阻，人情反侧，非所以广皇仁也。疏入，上解御用袍、赋诗以赐，加封靖海侯，世袭罔替，特旨赐戴花翎。
台湾既平，上遣侍郎苏拜至闽，与督抚及琅议善后计。时有议迁其人、弃其地者。琅疏言：台湾北连吴会，南接越峤，乃江浙闽粤之保障，弃之必酿成后患，留之诚永固边隅（疏载沿革表中）。上遂屏群议，置郡县焉。部议征赋略准郑氏故额。琅又疏言：故额太重不可准。且其地土著者少，被掠人民多归故籍，人去业荒，税将安出。请减旧额十分之四。又言：台地虽平，岛中诸贼不无漏网。此时海禁既开，倘内地奸民借名贩易，结党酿祸，不可不虑。请凡可通贩外国各港口，议定船数，每船议定人数，设法稽查，庶边患不萌，疆隅永固。得旨报可。泉、漳二郡自顺治十八年徙濒海居民入内地，荡析离居，至是琅请于朝，复归故土，民始安居乐业。二十七年入觐京师，赐朝服，复谕之曰：尔前为内大臣十有三年，当时闽人固有轻尔者，惟朕深知，待尔甚厚。其后三逆反叛，虐我赤子，旋经次第平定，惟有海寇游魂，潜据台湾，尚为民害。欲除此寇，非尔不可。爰断自朕衷，特加擢用。尔果能竭力尽心，不负任使，举六十年难靖之寇，殄灭无余，诚尔之功也。迩来或有言尔恃功骄傲者，朕亦颇闻之。今尔来京，有言当留尔勿遣者，朕思寇乱之际，尚用尔勿疑，况天下已平，反疑尔勿遣耶？今命尔复任。自此宜加谨慎，以保功名。从来功高者往往不克保全终始，皆由未能谨慎之故，尔其勉之！琅奏曰：臣年已衰，封疆重大，恐精神不堪。上曰：将尚智，不尚力，朕用尔，亦智耳，岂在手足之力乎。三十五年三月，卒于官，年七十六。赠太子少保，赐祭葬如典礼，谥襄壮，加祭二次。雍正十年，命入祀贤良祠。
琅居滨海，于海上风云气候甚悉。将攻澎湖，或言南风不利。琅曰：今攻澎湖，必由西屿头，然后转帆向东北，若北风则逆行矣。夫北风猛急，夜更甚，澎湖不能一朝克也。各岛皆为贼据，大洋之中不能下碇。舟从风散，军不能合，将何以战？惟夏至前后二十余日，风微浪静，夜可泊洋，聚而观衅，不过七日，举之必矣。及克澎湖，果七日。所用部曲、家将，经其指授，立勋绩、拥旌旄者，前后相属。子世纶、世骥、世騋、世骠、世骅、见列传，少子世范袭爵。世范卒，子廷皋袭。廷皋卒，子纯恺袭爵。
黄廷，漳州人，郑成功将，投诚封慕义伯。
周全斌，漳州人，郑成功将，投诚封承恩伯。
林兴珠字而梁，永春人。顺治间归诚，授福宁总兵，左迁副将，调辰州。值吴三桂乱，弃家归京师，封见义侯（前志云：授建义将军，加封建义侯）。滇南底定，授銮仪卫銮仪使。康熙时，俄罗斯筑城于索伦（州志：俄罗斯作罗叉），上命兴珠领藤牌兵五百征之。俄罗斯自古未通中国，见之，惊曰：此大帽军也；皆溃。兴珠乘胜毁其城。师还，以功官其子三人，旋落职。又从征厄鲁特，还，复其官，卒。
郑鸣骏字明发，南安人。明亡，与兄泰统所部屯金浦。康熙二年，率从子缵绪，以巨舰五百、将卒八千归诚，封遵义侯，予世职，隶旗籍。后征海有功，赐弓矢衣马十二事。卒，赐祭葬，子缵成袭封。
郑缵绪字哲孜，南安人。康熙二年，父泰为郑经所害，从其叔鸣骏率战舰甲士来归，封慕恩伯，世袭，隶旗籍。二十二年，从将军施琅征海岛，战有功，寻父尸归葬。诸岛荡平，镇泉州。年三十卒，子修典袭爵。康熙二十九年，从征噶尔旦，得一等功牌二。四十二年，赈饥东省，民为制衣一袭，后又督修高邮、邵伯河堤，以劳增一秩。
刘国轩，长汀人。台湾平，封顺清侯，授天津卫总兵。
李长庚字超人，一字西岩，同安人，幼异常童，甫入塾，即弄笔书唐李太白句云，天生我才必有用，其父希岸奇之，命以今名。第乾隆辛卯年武进士，授蓝翎侍卫，扈跸畿辅者三年，出为浙江衢州都司，累迁提标游击、太平参将、乐清副将。五十二年，林爽文乱台湾，闽大吏求良将于浙江，提督陈大用以长庚应，遂入闽权海坛镇总兵。以邻境民船被劫，误指为海坛界落职留缉，长庚不申辨，遽归散家财募乡兵，率子弟操舟入海，擒盗首林权，又击盗陈营于大岝。盗善火器，战屡却。长庚竿月镰断其缭，持短兵跃上贼船杀贼，须眉皆燎，大获而返。协办大学士福康安平台湾归，礼遇之。长庚慷慨请曰：长庚毁家为国，军食器械一不支官，惟火药非家物，愿便宜得调。许之。
初闽盗林明灼、陈礼等入浙海，戕参将张殿魁