保、巡抚陈璸、布政使沙木哈，建澎湖新城。胡氏「纪略」力辨其误，以为当时建议，后不果行者。而蒋氏「续编」，则疑为臆说。考妈宫澳之西，逼近海岸，有所谓新城者，小而坚致。今已改建，其为何时所筑，不可考矣。至如暗澳、瓦硐、大城山北各有城垣旧址（详见「古蹟」），然亦仅存其名耳。若嘉庆九年，副将王得禄于井仔垵社西南及妈宫港口之西城筑成短堞；光绪元年，副将吴奇勳于妈宫港以西之金龟头增筑炮台，皆为防海而设。要之，或高不盈丈、或仅容数百兵、贮炮数门以守隘口，均不得谓之城也。三水胡氏云：澎湖以大山屿为主，四面八方，岛屿罗列；外而大海周环，汪洋万顷；内而港汊分流，礁汕布伏。此则无形之金汤也。是说也，于王公设险之道，或有未尽。至于西屿外、内堑，为咽喉重地，莳里蛇头为妈宫唇齿，尤宜建炮城、驻重兵，用资防守，此实今日之第一要着耳。
祠庙
澎湖自归版图，即设有专官，以镇斯土，以主斯祀。虽无山川、社稷、风云雷雨诸坛与夫文庙春秋释菜之礼，而奉文致祭，载在典礼者，岁时肇举，斯亦守土者之所有事也。至于十三澳，各有丛祠，士庶奉为香火者，率皆土神，则亦仍之。兹以「寺观」「丛祠」附于后焉（节「纪略」）。
城隍庙：一在文澳旧厅署东偏，咸丰元年厅署典吏吕纯孝重修，但规模狭隘，未足展敬。一在妈宫城内，乾隆四十四年十月，前厅谢维棋捐俸，率监生郭志达等重修（有碑记。乾隆五十五年风灾，殿宇损坏，前厅蒋曾年捐修，添建后殿五间。嘉庆三年，前厅韩蜚声续修。二十二年十一月，前厅藩觐光以黄研罚项番银五十二元半生息之款，召匠修葺。道光四年，中殿前楹塌坏，前厅蒋镛重修。甲辰年十月，左营游击葡斐然、监生张腾赓，重新修建。光绪十一年法夷乱后，通判程邦基饬绅士黄济时、蔡玉成、徐癸山等捐赀重修。有碑祀）。
文昌祠：在书院后殿，乾隆丙戌冬创建，光绪元年董事蔡玉成等重建（有碑记，事详「书院」条内）。
奎阁：即魁星楼。在书院东偏，榜曰「登瀛楼」（事见「书院」条内）。
程朱祠：在城内。光绪十一年前厅程邦基建，绅士蔡玉成、黄济时、徐癸山监工（店业五间充香火）。光绪十九年冬，训导蔡玉成、黄济时、廪生薛元英、生员徐癸山等筹捐经费，于祠左隙地创建文昌阁，祠右隙地建立讲幄，增建耳房。以书院距城稍远，故于此地重建学舍，为师生讲学课文之所。济时以劳绩委赴彰化学教谕，令其子诸生钦明会同监工，至二十年四月完竣。
武庙：前在妈宫澳西偏。乾隆三十一年前厅胡建伟会营增修。后屡修葺，现已圯废，改建兵房。光绪元年，协镇吴奇勳择红木埕宽厂之地，重新创建（记载「艺文」），光绪间为法兵所毁。十七年三月，总兵吴宏洛捐廉五百金重修，添盖后殿，崇祀武帝三代，庙前开一半月池。
天后宫：在妈宫澳。康熙二十二年我师克澎湖，潮水涨三尺，井涌甘泉，知为神助。事闻，敕建神祠于湄洲（勒文以纪）；次年，加封天后。六十年，台匪窃发，我师进攻鹿耳门，水涨数尺，七日克复；巡台御史禅济布奉闻，赐「神昭海表」匾额。乾隆四年，前厅周于仁、协镇顾元亮、游击柳圆共捐三十六两，买黄明店屋，每月租银六钱半，为香火之费（勒石庙中）。庚午年间，前厅何器、澎协邱有章改造后殿（有碑记）。五十七年，协镇李南馨、游击罗光昭、黄象新、苏松镇孙全谋等捐修。嘉庆二十三年，前厅升宝、澎协陈一凯、护协萧得华、游击红鹤、李如荣倡修。
风神庙：在妈宫澳城隍庙东。乾隆五十五年十一月，前厅王庆奎、澎协黄象新、游击聂世俊、雷鸣扬捐建。嘉庆四年，前厅韩蜚声添买民房一间拆建。光绪七年，都司郁文胜倡捐重建，监生叶国梁董其事；八年四月落成。费一千二百八十余缗。除鸠捐六百余千文外，不敷者皆文胜先行垫给。
龙王庙：道光六年，通判蒋镛会同协镇孙得发、左右营游击黄步青、林廷福倡捐，择观音亭东边旧厢屋四间拆建。
施将军庙：在妈宫澳东街。前靖海将军水师提督施琅平台有功，封靖海侯，官民建祠祀之。通判蒋镛查在澎奉差因公遭风殁于王事者，皆无专祀，因筹捐铜钱三十二千文，发交盐馆生息；又筹捐铜钱四十千文，移营生息，附祭各木主于此以报之。
武忠祠：在妈宫澳协署西海边。遍询里人，不知建于何年，无碑记可考。乾隆五十六年，护协黄象新同左营游击罗光昭、升金门游击雷鸣扬、护右营游击聂世俊、守备李光显、连高升、董事高必成捐修。
胡公祠：在书院内文昌殿左。祀前通判之有功德斯土者：胡建伟、韩蜚声、蒋镛、王廷干等。
节孝祠：在天后宫西室。道光十八年正月署通判魏彦仪设。内祀：「纪略」所载十一人，「续编」所载百二十人，于春秋行祭天后礼毕后，同日附祭。同治六年，道宪吴檄行台、澎所属厅县举报节孝，援照福州之例，汇案请旌。时台湾有「阐幽录」，而澎湖讫无应者。咸丰间，有奸民将节孝祠为捐输局，祠内碑记、联匾皆被毁弃；幸诸生方景云仗义力争，卒得