旧制六员、嘉庆十四年裁归艋舺水师一员，道光六年裁归北路右营一员，并将右营原额六员裁归）、额外五员（旧制三员，道光六年裁归二员）、马八十匹，配马兵八十名（旧制马兵四十名，道光六年将右营四十名裁归）、战守兵一千三百十二名（旧制八百零六名，道光六年裁一百名归北路右营，将府治右营六百零六名裁归），共一千三百九十二名，驻府治南北路口。
镇标右营（道光六年裁）
旧制游击一员、守备一员、千总二员（嘉庆十四年裁归艋舺一员）、把总四员、外委六员、额外三员（嘉庆十四年裁归艋舺一员）、马四十匹、马兵四十名、战守兵八百零六名（以上旧制），道光六年裁游击一员、把总一员、外委一员、战守兵二百名，归北路右营添防。其千总一员、把总三员、外委五员、额外二员、马兵四十名、战守兵六百零六名，归府治左营兼管。
城守营
参将一员（驻札府治，统辖左右两军官兵）、左军守备一员（驻防岗山）、千总一员（与把总递年轮防罗汉门、冈山等汛）、把总二员（一员随防府治、一员与千总轮防冈山）、外委四员（递年轮防盐水埔、猴洞口、茂公、罗汉门等汛）、额外一员（协防府治）、马二十匹、配马兵二十名、步战兵二百二十一名、守兵二百九十四名，共兵五百三十五名，内战守兵二十八名，乾隆五十三年增设（道光五年裁归噶玛兰营，添防战守兵四十名）。现制马步战守兵四百九十五名（以八十五名随防府治，以一百四十五名分防冈山汛，兼辖山头、山腰、山尾等塘，以七十七名分防罗汉门，以八十一名分防猴洞口，以二十八名分防茂公汛，以一十九名分防盐水埔，以六十名分防涂堑埕、南炮台、港冈、埤仔头、角带围、大湖、半路竹各塘）、右军守备一员（驻防下茄苳汛）、千总二员（内一员乾隆五十三年增设，一员随防府治，一员分防下茄苳）、把总二员（递年轮防目加溜湾、大武垄等汛）、外委六员（内三员乾隆五十三年增设，递年轮防旧社、大穆降、大排竹、麻荳、目加溜湾等汛）、额外一员（协防旧社）、马二十匹、配马兵二十名、步战兵二百六十名、守兵三百五十二名，共兵六百三十二名（内战守兵二百一十五名，乾隆五十三年增设，道光五年裁归噶玛兰营战守兵三十名）、现制马步战守兵六百零二名（以一百七十三名随防府治，以七十名分防大武垄，以九十一名分防下茄苳，以四十一名分防目加溜湾，以四十六名分防大穆降，以四十四名分防旧社，以三十名分防麻荳，以四十五名分防大排竹，以六十二名分防北炮台、柴头港、茑松、木栅、湾里港、茅港尾、铁线桥、水堀头、急水溪、八奖溪、北势埔各塘）。
南路营
参将一员（驻札凤山县治，统辖本营下淡水营官兵）、中军守备一员（旧制驻防凤弹下埤头，乾隆五十三年移驻水底藔汛）、千总三员（内一员乾隆五十三年增设，一员随防县治，一员分防石井，一员分防水底藔）、把总四员（递年轮防县治、攀桂桥、石井、旧城等汛）、外委六员（递年轮防兰坡岭、坪仔头、蕃薯藔、竿蓁塘及随防县治）、额外四员（随防县治）、马三十匹、配马兵三十名、步战兵四百零九名、守兵六百名，共兵一千零三十九名，以五百二十名驻防凤山县治，兼辖坪仔头、打鹿潭、苦苓门等塘，以一百五十名分防水底藔汛，以一百六十名分防石井汛，兼辖兰坡岭、观音山、小店、竿蓁、二滥、溪边各塘，以一百一十六名分防番薯藔汛）。
南路下淡水营（乾隆三十三年分设）
都司一员（驻札山猪毛口汛，管辖本营官兵）、千总一员（分防新园汛）、把总二员（递年轮防万丹、山猪毛口两汛）、外委三员（递年轮防阿里港、枋藔、东港等汛）、额外二员（随防山猪毛口）、马十匹、配马兵十名、步战兵三百四十四名、守兵二百一十五名，共兵五百六十九名（以二百五十九名驻防山猪毛口汛，以一百六十名分防新园，兼辖东港、枋藔各塘汛，以八十五名分防万丹汛，以七十名分防阿里港兼武洛塘汛）。
北路协副将一员（驻札彰化县治，统辖本标三营官兵）
北路中营
都司一员（驻札彰化县治，管辖本营官兵）、千总二员（一员随防县治，一员驻防猫雾捒）、把总四员（递年轮防燕雾、八卦山、南北投、外四汛、许厝埔等汛）、外委九员（内三员乾隆五十三年增设，递年轮防大里■〈木戈〉、葫芦墩、二林、猫雾捒、四张犁、八卦山、南北投、崁顶等塘汛）、额外五员（内一员乾隆四十八年增设，一员乾隆五十三年增设，以二员随防县治，三员轮防触口汛、牛骂头汛、外四汛）、马五十匹、配马兵五十名、步战兵五百二十一名、守兵六百五十三名，共兵一千二百二十四名（内战守兵三百四十四名，乾隆五十三年增设，以六百零九名驻防彰化县治，以八十五名分防猫雾汛塘，以九十九名分防南北投汛塘，以九十二名分防燕雾捒汛塘，以五十名分防崁顶汛，以五十名分防大里■〈木戈〉，以三十名分防触口汛，以四十名分防葫芦墩，以三十名