围，乃得走至绵州。白文选亦大败广恩、含贞军，两人皆被擒。三桂惧甚，文秀追至，三桂遂弃绵州，走保宁；丧军资、士马数十万，皆不顾。曰：『生平未见此恶贼』。成都、潼、绵文武降人亦皆遁，文秀军大获复诸郡邑，鼓行追之如不及；王复臣言：『军骄矣，三桂劲敌不可忽也』！不听。
九月，樊一蘅在山中，闻范文光、詹天颜皆没，亦卒。
冬十月，文秀追三桂至保宁，王复臣请不围城，但以游兵断饷道，三桂必不能守；围则兵分，分兵则力弱。文秀轻三桂曰：『何怯也』！使张光璧军其西、复臣军其北。其地阻水，复臣又争之；亦不听。光璧，即流贼黑杀神；勇而轻敌。三桂遥望之曰：『是可袭也』。以精骑捣其军，果惊溃；转赴复臣屯，众大乱。复臣欲出，阻于水；三桂击之，复臣曰：『大丈夫不能生擒名王，岂可为敌所辱』！自刎死。文秀围解走，三桂不敢追；曰：『如复臣言，吾军烬矣』！敛其兵还汉中。文秀以兵戍成都、连昌、雅州、黎州、泸州、叙州。白文选使总兵杜子香守重庆，与谭文、谭诣、谭洪及十三家营相结。文安之自毕节入川东。
顺治十年（永历七年）秋七月，赵文贵在安龙，执巡道孙允干降；总兵胥荣明等亦降。
顺治十二年（永历九年）春二月，刘文秀入川南，大征士卒；制舟楫，将以东出。寻自湖北败还。
李国英上取四川状，请使吴三桂、李国翰以重兵屯保宁，先取成都；因其肥沃，且屯且守。次取重庆，以顾门户；然后顺流而东取夔门，通荆、襄之道，撤黔、滇之防。从之。
顺治十三年（永历十年）夏四月，四川总督魏勇以兵攻顺庆，降将霍光先击败之。
冬十月，夔州巡抚邓希明、总兵张志凯叛，出降。希明因乱屯田开县，入觐安隆；擢抚夔州。自是出降。
顺治十四年（永历十一年）冬十一月，田国兴、黄世鉴、邓昌基及孙可望将赵世超在巴东者，皆出降。
十二月，总兵谭新传降。
顺治十五年（永历十二年）春二月，洛托、洪承畴出湖南，卓布泰军及线国安出广西，吴三桂、墨尔根、李国翰出四川，三路趋云、贵。李定国闻之，使刘正国、杨武守四川之三陂及红关。
三月，吴三桂出汉中，历沔县、宁羌，顺流下至保宁；途中所见，一二烟火。比自西充至顺庆，刊山伐木，行无人径者千有余里。至于合州，杜子香以轻舟哨江上，三桂跨马挥军济；子香大骇，弃重庆遁。三桂偕墨尔根自铜壁、梁山入军重庆，使降将陈廷俊守之。招总制杨乔然，将官之；乔然仰药死。时成都、建昌、叙州、马湖、嘉定、雅州、黎州及资、简、蔺诸州犹为明，贺珍、王光兴、谭洪、谭谊、谭文、向希尧、杨秉允、徐邦定与十三家营在归州、巴县、大昌、大宁、万县、施州、巫山、忠、夔、达间者兵且数十万，各不能救。三桂亦不顾，惟使严自明助廷俊守重庆；自以兵进次黄葛江，为浮桥以济。溽暑蒸熏，军士多疾。明日，济綦江，历滴溜、三坡、石壶，皆峭壁重崖，一夫可守；李定国不及备。
夏四月，三桂次梓橦，总兵郭李爱等降。是月晦，陷遵义；刘正国、杨武望风溃。三桂降兵五千、得粮三万石，遂入贵州；寻还屯遵义（详后）。四川所属酉阳宣慰使冉奇镳、蔺州宣慰使奢保受皆降。
秋七月，文安之闻滇急，急督十三家营攻重庆；师由水道进，袭三桂后。严自明力守，安之再以兵攻重庆。李国英攻川南郡邑在忠、万间者，多破败之。
顺治十六年（永历十三年）春正月，文安之再以兵攻重庆，谭洪、谭谊固不悦；谭文行至合江，谊杀文，洪助之。安之将率十三家营讨杀文者，谊即赴李国英军降，洪亦降。安之愤恨，遘疾卒。
二月（明闰正月），雅州将高承恩闻永历帝已西行，独不降；敛其部及诸土司兵以拒守。凡五月，其弟承裔杀之。
闰三月（明三月），狄三品、冯双礼自金沙江溃入四川之建昌卫，吴三桂招之，且使诱川中诸将；三品执冯双礼降。白文选将王安亦自建昌以其金印降，延长伯朱养息、总兵龙赞阳、吴宗彦以嘉定州城降。
六月，三桂兵至马湖、叙州，提督陈希贤降；杜子香、陈进贤以成都省治降，总兵赵友鄢、御史庞之泳、主事贺奇及乌撒土司安童圣皆降。时三桂等自云南返取四川，所过崩溃，曾不血刃。严自明在永宁，亦招杨国明、武国用等降；忠州副将陈世凯亦降。
降臣高明瞻又尽定川西北地。惟朱化龙在茂州固守，不肯降；寻城破，死。
冬十月，高承裔以邛、眉、雅、黎、资、简州降；王友进亦降。而川南之地，尤躏于降将李应林等。复有抹脸贼，剜人面；盖妖党也。
顺治十七年（永历十四年）秋八月，高承裔以雅州复为明；李国英攻之。
顺治十八年（永历十五年）夏四月，李国英攻承裔于竹山关，承裔走黎州；又败，匿于篁中被执，死。