师降，且告献忠所在。十二月，王师杀献忠于盐亭，贼兵悉溃而南。
时，英驻重庆，称最强。可望猝至重庆，英出不意，败死；贼遂陷綦江。督师应熊退避毕节卫，未几，死；永明王以吕大器代之。
四年（丁亥），贼入遵义。而是时大兵入川，所至俱下；大海退入于涪，袁韬去夔而入于黔之婺川，占春避而东下，诸拥兵者率瓦解，川北尽入版图矣。已而，王师追贼至遵义，粮尽引还。于是，王祥等复入保、顺二郡。一蘅再驻江上，为收蜀计；上表永明王，王以一蘅为户、兵两部尚书，加太子太傅，诸将祥等进爵有差。于是，韬复入重庆，大海占云阳，占春据涪州，诣据巫山，谭文据万县，弘据天字城，天锡据永宁，应试据芦卫，祥据遵义，展据嘉定，化龙、勋等各据地自擅；而宗室朱容藩及故偏沅巡抚李乾德以总制至，杨乔然、江尔文以巡抚至，各自署置，官多于民。李自成余孽李赤心、郝摇旗、袁宗弟等复扰夔、巫间。一蘅令不行，惟叙州一郡而已。
五年（戊子），容藩自称楚世子、天下兵马副元帅，建行台于夔。武冈之败，传永明王已死。大器过占春营，具言王无恙；容藩乘机僭窃，当得罪。占春以为然，李乾德亦传檄声容藩罪。容藩益窘，乃北依二谭，以兵攻石砫。占春援之，容藩兵败，走死云阳。是时，川地咸附于永明王。
乾德者，少好占验；至蜀诸将中，惟许韬及武大定，遂结二人为腹心。韬故献忠别部，所称姚、黄十三家贼；大定，则小红狼别部也。韬与占春素不协，时驻重庆，兵强而饥；乾德遣人说展，与合兵。展与占春素厚，富而弱，藉袁、武之强以自固，纳之，约为兄弟。然展能与袁、武合而不欲与占春绝也，时通闻问，馈以银米；袁、武有所求，顾不甚遂，因恨展。既韬徙屯犍为，展以生辰来为寿；乾德因说韬杀展，而分其资。展死，诸将皆解体，故乾德卒至于败。可望闻展死，将图蜀，乃为展讼冤；使王自奇将兵由川南进，而别遣文秀及白文选渡金沙河、出黎州，败王祥于乌江河，取曹勋而袭其后，趋嘉定。时袁、武方拒自奇于川南，撤师还救；自奇尾击之。袁、武大败，悉就擒；乾德投水死。兵复东，三谭俱降；乃遣别将卢名臣下涪州，占春败走。大海在忠州知不支，引兵出夔入楚，与占春来降于王师。文秀遂据蜀。
七年（庚寅）正月，文秀还云南；令文选守嘉定、刘镇国守雅州。三月，大兵南征，文选、镇国俱败。王师人嘉定，文光、天颜死之。初，展之死，文光入山不视事，至是死焉。九月，一蘅亦死于山中。蜀中将士俱尽。
九年（壬辰），文秀、文选率兵来攻保宁；大兵奋击，破其象阵。
十六年（己亥），弘、诣俱纳款。时，弘、诣已杀文，文安之与刘体仁、李来亨等欲讨之；二人惧，来降。未几，取马湖、叙州；降牟胜于武隆，赦而用之。于是，献孽之扰蜀者亦尽。
自成遗孽郝摇旗、袁宗弟、刘二虎等尚据巴东。十八年（辛丑）奉旨三省会剿，王师驻万县，贼弃夔州。康熙元年（壬寅）正月元旦，大军衔枚进，夺羊耳关；贼焚天昌县以遁，二年（癸卯），复犯巫山；大军与鏖战，而遣兵密斫其营，贼大溃。二虎投缳死，追摇旗、宗弟获之。蜀地悉平。
郑成功之乱
郑成功，南安人。父芝龙，娶倭妇生。初名森；芝龙见森于唐王，王奇之，赐国姓，名成功。顺治二年（丙戌）三月，王封成功为忠孝伯。福州破，成功母死于兵，成功号恸不自胜。芝龙约降，成功泣谏；不听。我贝勒挟芝龙北去，成功遂与所善陈辉、张□等乘二舰入海，收兵南澳，得数千人。
四年（丁亥），闻永明王由榔僭立于肇庆，文移用永历年号。成功归自南澳；时厦门、浯州为郑彩、郑联所据，乃泊鼓浪屿。厦门者，中左所也；浯州者，金门也。隶同安，为两岛。
七月，入寇海澂，不克而还。
八月，与鸿逵合攻泉州，败我提督赵国佐于桃花山，遂围泉州。五年（戊子），我副将王进自漳来援，成功解围去。
三月，攻同安，守将王彪、折光秋弃城走，遂入之；复寇泉州。九月，我佟国器、陈锦、李率泰援之，成功乃退，大兵屠同安。
六年（己丑）二月，遣施琅、杨才、黄廷、何宸枢等寇漳浦；守将王起凤降，授伪铁驻镇，寻改伪正兵镇。遂下云霄，抵诏安，屯分水关；令黄廷、何宸枢守陀岭。官军攻盘陀，宸枢死焉。
七月，永明王遣使至岛，封成功为广平公。
七年（庚寅），潮人黄海如、陈斌道成功入潮州，败我师于潮阳。师还，遂入两岛。两岛为郑彩、郑联所据，成功师抵厦门，联方醉卧万石岩；报至，不得通。诘朝酒醒出见，成功笑曰：兄能以一军见假乎？联未及对，诸执锐者前矣。遽麾军过联船，兵士皆讋服，莫敢动；遂并联军。彩率所部遁于南中，巳杀联而复彩。成功将至，彩议全军出避；联不从，又不设备，故及。成功既入两岛，军势益强，海寇皆属焉。