宜协心辅余不逮！”遂诣奉天殿，即皇帝位，革除建文四年，仍称洪武。谕府部：“凡建文中改易皇考政令，悉复旧。”庚午，诏复周、齐、代、岷四王爵土，又封有勋为汝南王，有烜为顺阳王，有爝为祥符王，有熹为新安王，有光为永宁王，有煽为汝阳王，有炉为镇平王，有弗为宜阳王，尚烐为兴平王，尚灶为永寿王，尚灴为安定王，济熿为平阳王，济熇为广昌王，贤烶为乐安王，贤焌为长山王，贤[1234]为平原王。辛未，升燕山护卫为亲军指挥使司。召文学博士方孝孺草诏，孝孺不往，迫之，以衰麻见。上怒，逮诣诏狱。是日，纪善、周是修留书别，杨士奇等具衣冠入应天府，学自经于东庑。上闻之，叹曰：“彼食其禄，自尽其心耳！”于是，大理丞邹瑾、太常少卿廖升、翰林侍讲楼琏、给事中龚泰、监察御史魏冕皆自裁。未几，获兵部尚书铁铉、礼部尚书陈迪、刑部尚书暴昭、侍郎侯泰，户部侍郎郭任、卓敬，御史大夫练子宁、茅大芳，大理少卿胡闰与文学博士孝孺。上俱欲用之，示其意，铉等执不从，遂就刑。壬申。上以天子礼葬建文君及皇后马氏。翌日，诏复懿文皇太子懿，敬皇太子妃旧称，罢其庙祀，迁主于园陵。改封吴王允熥为广泽王，衡王允爁为怀恩王，徐王允熙为敷惠王。废魏国公辉祖为庶人，寻被□卒于狱。执齐泰、黄子澄。召驸马都尉梅殷及都□杨文、陈晖、韩观、黄中等还京师，所领将士各还原卫，勇士悉放归农。丁丑，杀齐泰、黄子澄，皆夷其族。时礼部侍郎黄观、礼科给事中黄钺、翰林修撰王叔英、监察御史曾凤韶、浙江按察使王良、江西按察副使程本立、督府断事高巍皆使于外，闻靖难兵入都城，观、钺皆投水；叔英、凤韶、本立、巍皆雉经；良举火自焚；翰林编修程济、按察佥事胡子义、宁波知府王琏、卫辉知府孙镇、郎中梁田玉、中书舍人宋和、郭节皆弃官而去。其它变易姓名，隐迹山谷者不可胜纪。
秋七月壬午朔，类于南郊，诏告天下。遣使祭告祖陵、皇陵、历代帝王陵。改谥湘王曰“献”，妃曰“献妃”。召吏部尚书张紞、户部尚书王钝，谕之曰： “卿二人久事先朝，习知典故。今老矣！其解职务，月给尚书半俸，居京师视时政。有戾旧制者，直以告朕。”是夜，紞自经于部之后堂。其妻与二媵、二子隶六人相继投水而死。钝遁不果，左授浙江左布政使以归。诏至漳州府学，教授陈思贤帅诸生为旧君位哭，临郡人执送京师。思贤暨诸生六人皆死之。是月，以郑赐为刑部尚书，郁新为工部尚书，蹇义、陈洽为吏部左、右侍郎，夏原吉、古朴为户部左、右侍郎，宋礼为礼部侍郎，黄福为工部侍郎，方宾为兵部侍郎，黄信、陈瑛为副都御史，刘翥、杨得安、俞士吉为佥都御史，李至刚为通政使。
八月，诏谕安南、暹罗、爪哇、琉球、日本，西洋苏门答刺、占城诸国。己未，秦王如京师。以袁廷玉为太常寺丞。癸丑，代王及其世子逊瑞如京师。是时，岷王与西平侯晟交恶，诏为平之，复命王佐副晟协守。壬戌，晋王如京师。丙寅，执左都御史景清。先是，星者奏：“文曲犯帝座甚急！”上固疑。及见清衣绯而入，委蛇不去，上呼左右收之，得衣衽中所匿利剑。因诘责，清亦吐实而死。己巳，以夏原吉为户部尚书，金忠为工部侍郎。免畿内今年丁夫之役。下谷府长史刘璟狱。璟，诚意伯基之子也。北伐时从王朝京师，献十六策不用。璟病免至，是召不起，逮赴诏狱，辫发自经死。又逮礼部侍郎黄魁、太常少卿卢原质、左拾遗戴德彝、监察御史高翔、晋府长史程通、苏州知府姚善、徽州知府陈彦回，俱以不屈就市。
九月甲申，大封功臣。以都督佥事丘福为淇国公，朱能为成国公，张武为成阳侯，陈圭为泰宁侯，孟善为保定侯，郑亨为武安侯，火真为同安侯，顾成为镇远侯，王忠为靖安侯，徐忠为永康侯，张信为隆平侯，李远为安平侯，郭亮为安成侯，都指挥使王聪为武城侯，房宽为思恩侯；唐云为新昌伯，刘才为广恩伯，徐理为武康伯，都指挥佥事徐祥为兴安伯，孝浚为襄城伯，孙岩为应城伯，赵彝为忻城伯，陈旭为云阳伯，房胜为富昌伯，指挥使张辅为信安伯，谭忠为新宁伯。又以翊戴功封都尉王宁为永春侯，尚书茹常为忠诚伯，都督佥事王佐为顺昌伯，陈瑄为平江伯，曹国公景隆加禄一千石。其余将校升赏有差。上犹虑论功有未当者，复命福等议拟以闻，福等乃言：“信安伯辅屡立奇勋，父又死难；都督李彬、陈贤、张兴、陈志、王友俱有先锋摧敌之功，与伯刘才埒、陈亨子懋、王真子通俱未授爵，宜准谭忠例请。”上从之，进封辅为新城侯，彬为丰城侯，懋为宁阳侯，贤为荣昌伯，兴为安乡伯，志为遂安伯，友为靖远伯，通为武毅伯。翌日，追封都督同知张玉为荣国公，谥“忠显”；陈亨为泾国公，谥“襄敏”；徐增寿为阳武侯；寻进封定国公，谥“忠湣”；都指挥谭渊为崇安侯，谥“壮节”；百户王真为金乡侯，谥 “忠壮”。以蹇义为吏部尚书，刘俊为兵部尚书，黄福为工部尚书。诏诸蕃入贡者互市如故。己丑，庆王如京师，周世子有炖自临安入朝，越三日。壬辰，颁世子有敦金宝，周王言于上曰：“向者不轨之诬，非世子自婴其祸，无逮今矣！