尾。守赤嵌城夷长猫鸡实叮发炮死击营垒并焚马厩粟仓。成功恐焚及赤嵌卫，令杨朝栋督张志统兵防御。
初三日，陈泽扎营北线尾。守台湾城夷长揆一见海师未齐，遣头目拔鬼仔率鸟铳兵数百直前邀击。陈泽迎战，一鼓歼之。拔鬼仔战死，余夷退走。
初四日，赤嵌城夷长猫鸡实叮以孤城救之，成功遣杨朝栋招谕之，遂率夷人三百余人出降。成功令赤嵌夷招夷长揆一等来降，不从。时夷人尚有甲板船在港，令陈泽、陈广等攻之，沉其一只，焚其一只，走回一只。成功督师移扎七鲲身以逼之，筑土台架炮攻台湾城。揆一等于附城、铳城齐放大铳，顷刻土台崩坏，海兵退回。夷人出城夺炮，马信、刘国轩率弓箭手射之，乃退。成功遂令赤嵌降夷架铳击其铳城，崩之。派马信等扎台湾卫固守不攻，俟其自降，成功又使人告之曰：『此地乃先人故物，今我所欲得者地耳，余悉以归尔』；红夷乃降。
成功派各镇分扎汛地屯垦。
五月初二日，二程黄安、刘俊、颜望忠、陈瑞、胡靖、陈璋等到台湾。
成功集文武各官，审宣毅后镇吴豪抢夺民财，兼匿米粟，斩之；右虎卫陈蟒同罪，革职捆责，以黄安管右虎卫。
成功既得台湾，制律法，兴学校，改台湾为伪安平镇，赤嵌城为伪承天府，委杨朝栋为府尹；一为天兴县，委庄文烈知县事；一为万年县，委祝敬知县事。
六月十六日，铜山守将蔡禄、郭义抢掠居民，胁忠匡伯张进投诚。进诈许，置酒请会，欲发火药与之俱焚。蔡、郭知之，不赴。张进遂纵火自焚。初，后提督万礼密约海澄公黄梧，欲据思明州投诚，后随攻南京被获而死，已祀忠臣祠矣，事泄，成功撤其木主；蔡、郭是其党也，故惧而叛。大兵入铜山城，兵官洪旭会忠勇侯陈豹统水师追之，蔡、郭同大兵退走。报至，成功拔总监营翁天佑镇守，而厚恤张进之家。
七月，红夷会甲板船至。成功调右武卫前协裴德协守台湾。
张志、黄昭等激变大肚社土番，杨祖与战，中标枪死。土番围张志营，黄安、陈瑞等击走之。
八月，红夷率甲板船来攻。成功令陈泽同戎旗左右协水师击败之，获甲板二只、小艇三只。自是甲板退入台湾港，不敢复出。
朝命户部尚书苏纳海至闽，迁海边居民之内地；离海三十里村社田宅，悉皆焚弃。先是，达素兵至，成功令思明州撤空，其北人来降者，家眷乘隙皆渡海逃去。成功右提督班秀奇亦逃回江南，埋名不出，而原任漳州知府房星晔者，为索国舅门客，遂逃入京，使其弟候补通判房星曜上言，以为海兵皆从海边取饷，使空其地而徙其人，寸板不许下海，则彼无食而兵自散矣；遂从其策。升房星晔为道员，病死无嗣。至是，上自辽东，下至广东，皆迁徙，筑短墙，立界碑，揆兵戍守，出界者死。百姓失业流离，死亡者以亿万计。
苏纳海归，荐同安总镇施琅为水师提督，移镇海澄。
十月，同安侯郑芝龙为其家人尹大器出首通海，时今上新即位，四辅苏克萨哈与郑芝龙有隙，以初三日磔芝龙于菜市，杀其子孙家属凡十一人，囚郑芝豹于京师，锢守之。报至台湾，成功叱为妄传，然中夜悲号，居常郁悒。
十二月，守台湾城夷长揆一等乞以城归成功，而搬其辎重货物下船，率余夷五百余众驾甲板远去。成功遂有台湾，改名东宁。成功以各社田土分与水陆诸提镇，而各令搬其家眷至东宁居住。兵丁俱令屯垦。初至，水土不服，瘴疠大作，病者十之七八，死者甚众。加以用法严峻，果于诛杀；府尹杨朝栋以其用小斗散粮，杀其一家；又杀万年县令祝敬，家属发配；于是人心惶惧，诸将解体。
壬寅（康熙元年、海上称永历十六年）
正月，成功严谕搬眷。郑泰、洪旭、黄廷等皆不欲行，于是不发一船至台湾；而差船来调监纪洪初辟等十人，分管番社，皆留住不遣。岛上音信隔绝。
三月，成功令周全斌调铜山、思明州兵攻南澳，欲擒陈豹。豹短小精悍，号「三尺陈」，守南澳近二十年，许龙、苏利皆畏之；但骄傲专恣，数违藩令。兵至，仓猝率众搬眷下船，不敢十分迎敌，扬帆入广东投诚，朝命封为慕义伯。未几，病疫而死。
四月，成功有宠妾董夫人在思明州，长子经乱之，生子。子生，报台湾，成功大喜，高宴累日，问所自出，皆云不知。既而微知之，大怒，命工官杨都事赍令箭到思明州，欲杀董夫人及长子经，并左右五人。首洪旭，经妻父也。黄廷与洪旭密谋；『国姓以盛怒命杀其子，国姓无他子，倘后而中变，喜怒不可知，不若姑缓之，须后命』。遂杀杨都事，不奉令。又讹传周全斌奉密谕欲杀诸将十余人，于是人人自危。洪旭等候周全斌船回厦门港，即执而拘之。黄廷劝郑泰杀全斌，全斌求救于董夫人，洪旭亦依违，乃得免。
五月初八日，成功病卒于台湾，遗命『子经不肖，不堪负荷，文武各官俾辅幼弟为台湾主」。提督马信、镇将黄昭