攻郑锦，遂复漳州、泉州诸府。
丁巳、康熙十六年
收复惠、潮诸府。
上年康亲王之师收复漳州、泉州后，至是惠州、潮州亦反正，郑锦遁入厦门。
戊午、康熙十七年
郑锦复侵沿海城堡。
锦在厦门复集众侵沿海城堡；诏复迁滨海居民，申旧禁。
己未、康熙十八年
总督姚启圣、提督杨捷解漳州、泉州围，进克海坛、金门、厦门。
郑锦将刘国轩等复陷海澄，官军死者三万余，都统赫穆林、提督段应举皆遇害。诏罢总督郎廷相，以姚启圣代之；与提督杨捷夹攻，解漳、泉围。国轩遁还海澄，扼守诸岛，相持久不决。乃厚积舟师，并檄荷兰夹板船助剿；未至，官军已克复海坛、海澄，进逼厦门。国轩遂弃金、厦二岛，遁归台湾。
庚申、康熙十九年
贝子赖塔贻书招郑锦。
先是，总督李率泰贻书招锦。至是，贝子赖塔复贻书招之。锦请如约，惟欲留海澄为互市地；姚启圣不可。
辛酉、康熙二十年
复展沿海居民地界。
时沿海府州县及金、厦二岛均已收复，总督姚启圣、巡抚吴兴祚疏请沿海居民展界复业；从之。
癸亥、康熙二十二年
夏六月，水师提督施琅征台湾，平之；郑克塽降。
先是，郑锦频年出兵在外，用陈永华言，命子克■〈臧上土下〉监国；长而才，然婢出也。二十年，锦卒，成功妻董氏入间言，杀克■〈臧上土下〉。而立次子克塽，袭延平王；幼弱不任事，事皆决于侍卫冯锡范，人心益失。于是总督姚启圣奏：郑锦死，子少、国内乱，时不可失。时塽将刘国轩贻书启圣，请如琉球诸国例，称臣入贡。启圣以闻，上不可；命进兵。将出师，启圣欲候北风直取台湾，施琅欲乘南风先取澎湖。奏言：『澎湖不破，台湾无取理；澎湖失，则台湾不攻自溃。请以战舰三百、水师二万，独任讨贼，而留督臣厦门济饷』。诏从琅策。
时刘国轩拥众守澎湖甚严。我军次七罩湾，适潮涨，舟乘以进。会飓风夜发，怒涛山立。国轩垒壁环二十里，四面列巨炮。琅亲督大舰冲围，矢集琅目，不少却。国轩自率二万人泊牛心湾，别屯万人于鸡笼屿相犄角。琅乃分兵三路，以五十艘出鸡笼为奇兵，分敌势；自督五十六艘分八队，攻其中坚，又以八十艘继后。每路中复各分三队，不列大阵，约以五艘攻其一艘，人自为战。酣鏖竟日，声震数百里，焚百余艘、杀万有二千人。凡海洋占候：云合风生，雷鸣风止。是日将战，黑云起，敌方相贺。忽闻霹雳，皆惊愕失色，遂大败，国轩由吼门冒险突围而逸。我军乘势至鹿耳门，胶浅不得入；泊海中十二日，潮不至。忽大雾，潮高丈余，舟师平行而入；郑氏惊曰：『先王得台湾，鹿耳门涨。今复然，天也』！于是遣伪官郑平英等赍表至施琅军前降，琅请颁赦招抚。上谕郑克塽曰：『帝王抚御寰区，仁覆无外；即海隅日出之邦，无不欲其咸登衽席，共乐升平。尔祖父自明季以来，出没海洋、盘踞岛屿。本朝定闽后，尔祖郑成功窃据海隅，甘外王化；以及尔父郑锦勾引奸徒，窥伺内地。屡经剿抚，顽梗怙终。尔方童稚，妄思效尔前人，倚险负固，飘突靡常；故特选将练兵，出洋进剿。尔等果能悔罪投诚，率所部伪官军民人等悉行登岸，将前罪尽行赦免；仍加恩安插，务令得所。尔等其审图顺逆，善计保全，以副朕宥罪施仁至意』！克塽遂率刘国轩、冯锡范等俱薙发降，台湾平。
台湾在闽海中，纵千有余里、衡四五百里。地脉自福州鼓山越大洋，为澎湖诸岛。又东二百里为台湾，起鸡笼山，南尽沙马碕。东南渡洋为小吕宋，东即大东洋，东北直琉球、日本，北则朝鲜、盛京，西北为青、徐、江、浙海疆，西与福、泉、兴、漳相值，西南走交广，樯帆相接。滨海土地饶沃，一岁三熟。山前多泉、漳、惠、潮民徙垦；山后皆土番所居，曰社。有三百余社，分生、熟二种。生番居深林密箐，言语不通；熟番亦与居民杂处通市。而皆射生饮血，嗜杀械斗。土产布、榖、五金、煤矿、毛羽、皮革、竹木、丝、漆、蔗糖甚丰。其地古不与中国通，罕有至者；即「宋史」所谓『澎湖东有毗舍那国』是也。明嘉靖后，海贼林道干窜踞；后为郑成功所有。至是，施琅言台湾一岛之地，实腹内数省之屏蔽，弃之恐转资荷兰；上可其奏，命籍之。初置府一，曰台湾；县三，曰台湾、曰诸罗（乾隆时改嘉义，分设彰化）、曰凤山，以知县理之。又设兵备道一、总兵官一以统辖之，饬戎备焉。
开海禁。
时沿海居民虽复业，尚禁商舶出洋互市。施琅等屡以为言，又荷兰以曾助剿郑氏，首请通市；许之。而大西洋诸国因荷兰得请，于是凡明以前未通中国、勤贸易而操海舶为生涯者，皆争趋疆臣，因请开海禁。设粤海、闽海、浙海、江海榷关四：于广州之澳门、福建之漳州、浙江之宁波府、江南之云台山