八月，京中遣户部郎中贲（原文为贡）岱、兵部郎中金世德入闽安城招抚。凡海上文武官员投诚者，依例照品级升降补用。
十月，洪旭、郑泰以兵千余人配船，送世藩（名经）入台湾。世藩以周全斌为五军、冯锡范（澄世之子）为侍卫、陈永华为咨议参军。至澎湖，其将李思忠船飘至台湾，知诸将有谋，逃回；世藩随即防备，因乘风入鹿耳门登岸，全斌令连夜伐木为栅九（？）营。次早，黄昭会诸将出兵，值大雾，昼暝，跬步不可视，诸将多迷误失期。惟黄昭兵先至，攻其前；刘国轩兵继至，攻其后，破营而入。世藩兵却挤（？）而前，黄昭攀木梯而登，为流矢所中，坠下。全斌令斩其首，大呼示众，军士皆迎降。大雾忽晴，日已晌午；锺宇等至，皆反戈而迎。世藩入安平镇，请世袭至，待之如初。袭委罪于其仆蔡云，云自缢；收杀萧拱宸、李应清、曾从龙等，余皆不问。诸将营兵，拨守汛地如故。
十一月，世藩率周全斌等同其叔世袭回思明州。后世袭入京归命，授精奇呢哈番；颜夫人、郑芝豹自戍所发回，准在京同住。癸卯，康熙二年、海上称永历十七年。
正月，世藩驻思明州，时洪旭守思明、郑泰守金门、黄廷守铜山。世藩得郑泰与黄昭往来书，欲袭取之；泰不自安，称病不见。
三月，命周全斌督船入海澄港取粮，欲袭金门；见其有备，乃止。
四月，参军陈永华谋以世藩将回东宁，诈征郑泰为居守户官，统辖诸镇，资其饷给兵。铸「居守户官」印，遣吴慎赍至金门。泰使弟鸣骏入谢，世藩慰谕之；见陈永华，情款甚笃。鸣骏回，力劝兄行；泰遂于六月初六日带兵船并饷银十万至思明。是晚入城赴席，世藩以通书黄昭事面质之；遂交与洪旭监留。周全斌率兵并其船，独蔡璋一船走脱。天未明，至金门，鸣骏仓卒与泰之子缵绪率将士八千余人向总督李率泰投诚，全斌追之不及。鸣骏等至京，俱受封。泰闻之，自缢。
七月，以黄而辉（廷之子）为思明知州。
八月，自郑鸣骏降后，人心解散，镇营多叛；武职杨富等、文官陈彭等皆先后投降。
九月，红夷纠集甲板船十六只、夷人数千，会靖南王、李总督约同攻两岛；候事定之日，求浯屿筑城贸易，如广东香山□（澳）例。后准纳贡互市。
十月，李总督定议，调陆路提督马得功督郑鸣骏等出泉州港，水师提督施琅同海澄公黄梧出海澄港，靖南王耿继茂同荷兰国红夷扎营于同安之刘五店，刻期渡海。守高崎正兵镇陈升先约降。
十一月，世藩率周全斌等会兵船于金门。红夷船高而大，一船有大小熕铳千余号，横绝中流。是日炮声如雷，自辰至酉，相继不绝。世藩见势不敌，乘潮退出浯（原刊为梧）屿。周全斌等十三号船在后，迫于潮长不得出，遂绕夷船之后，冲大■〈舟宗〉而入；夷船发熕齐击，无一中者。马得功坐鸣骏中军船，全斌以为鸣骏也，直前攻之。值黄廷中军将吴朝宰、世藩之亲军萧乘龙前后夹攻，挥兵过船，得功亲随铁甲精兵三百人，皆被杀下水，得功顿足投水死。再攻杨富船，焚之，富亦投水，遇救得免。所遇之船，多被攻没，遂扬帆直出。日暮收兵；而海上不知马得功之死，竟弃两岛，退守铜山。清兵入岛，岛中民尚数十万，多遭白刃；投诚兵复肆杀掠，其地遂空。甲辰，康熙三年、海上称永历十八年。
正月，世藩驻铜山，诸军乏粮。周全斌率众投诚，入京封伯。洪旭以杜辉守南澳，辉亦掠其辎重投诚。
三月，世藩率众回东宁。工官冯澄世一船为家丁所迫，赴海死。洪旭以二十舟候黄廷同行，而廷部下将士多不愿行，遂率众投诚。
八月，清议取台湾，遣施琅挂「靖海将军」印，即以周全斌副之。整舟师，候风开洋。
乙巳，康熙四年、海上称永历十九年。
四月，清官军船出洋，飓风大作，各船飘散，不能相顾，皆引还。未几，召施琅入京，其降将多叙用。丁未，康熙六年、海上称永历二十一年。
部议分拨海上投诚官兵移驻外省，召周全斌入京归旗。其标下官兵及别镇兵各给行粮，分驻各省屯垦荒田；给以牛种，免其六年租税。其将领或督垦、或拨各衙门效用；文官赴部候补。己酉，康熙八年、海上称永历二十三年。
世藩在东宁，以陈永华理政、冯锡范管侍卫、刘国轩等管兵。忠振伯洪旭病故，其子磊及永华之侄绳武等俱任用。
改天兴、万年二县为州，置凤山、诸罗二县。课耕种，安抚土番，贸易外国，通鱼盐。向之惮行者，今皆为乐土焉。
清遣官渡海招抚。世藩请照朝鲜国例，不剃头、不登岸；议竟不成。癸丑，康熙十二年、海上称永历二十七年。
十一月，吴三桂反，陷云南、贵州、四川、河南、岳州诸郡县，伪称大周元年。初，平南王疏请归老辽东，留子之信袭职镇守；许之，并令举家归旗。时平西、靖南相继疏请，俱报可。至