抚李天宠为民，以侍郎杨宜兼佥都御史代琉。以御史胡宗宪代天宠。先是上闻琉疾甚，又以天宠嗜酒废事，遂并斥之，乃命赵文华悉心督察，命礼部铸督察关防，驰赐之。
三板沙倭贼夺民船出洋，参政任环督总兵俞大猷引舟师追击于马迹山，擒倭首滩舍卖，及贼五十七人，斩首九十三级。是日，倭舟被海风飘回者五十人，屯嘉定民家。环率兵攻之，不克，乃投火民舍爇之，贼尽死。既而环有亲丧，按臣周如斗以倭寇未平，请留之。诏夺情任事如故。
七月，倭犯南京。先是高埠逃倭，自杭州西掠至淳安，仅六十余人，以浙兵逼急，突入歙县，流劫至南陵，趋太平府时，掺江都御史史褒善，驻太平督兵御之。贼引而东犯江宁镇，守备遣指挥朱襄等，率勇士数百人出。时贼已至板桥，襄等怠缓，不知袒荡，纵酒，一遇贼。尽为所歼。群贼沿途杀人，由安德、凤台、夹岗各门外乡落，抢掠，趋秣陵关。时应天推官罗郎卿、指挥徐豕宗率兵千人守关，望风奔溃，贼遂过关而去。
赵文华言：始者，贼逸松江也，宣慰彭盖臣等与贼相持十昼夜，贼遁苏州。盖臣及俞大猷、任环合兵追之，于陆洷坝，斩首五六百级，兵势稍振。顷二司兵失利，而贼遂散逸。一犯宜兴，一犯长兴，势复猖獗，良由吾兵寡势分，士气不扬耳！臣以为，盖臣等报效之勤，宜劳寇至苏州，我军尽云火器委诸贼中，而又海上福沧等州七十余船，皆为贼毁。臣以为，诸臣失事之罪，宜问兵部覆议。上命降敕奖励彭盖臣、彭明辅，各赐银二十两，纻丝一表，里官舍、彭翼南，准实授生员，彭守忠给与冠带，其福沧兵船被毁失事，会按臣覆实以闻。
巡按直隶御史周如斗，因常熟之败，疏言越浦之寇，蔓延内地，流毒日深，诸臣防御失策，致镇抚孙宪臣身婴贼锋，知县王秩、乡官钱泮，继及于难，前后虽有小捷，所丧败实多。因参兵备副使任环，功不掩过。海防佥事董邦政，罪浮于功，及巡捕同知王如瓒、把总姜旦等，失守慢防之咎，请恤录宪臣等，而正环等罪。又言永顺、保靖之兵，屡战多捷，实湖广副使孙宏轼、参议王维洛监督有方，及官舍、彭翼南、彭守忠等实心干济，请优赏以示。兵部议覆。诏：宥环，下如瓒等，于御史问。赐宏轼、继洛各银币。赠宪臣指挥佥事，袭，升其子三级。
南京御史叶恩，以倭破杭州北新关，劾奏提督李天宠失误军机罪，宜重治，诏差官校逮问。时胡宗宪亦疏劾天宠纵寇殃民，参将尚允绍等防御寡谋，请罢天宠而治允绍等罪。得旨：天宠已逮，允绍姑革职充为事官，与守巡官俱夺俸，令戴罪自效。已，天宠诣京下狱，竟以失律丧师论死西市。
张经、汤克宽逮至，诏下法司议罪。经上疏自理言：倭寇嘉兴，即委卢镗督保靖兵援，嘉兴委俞大猷督永顺兵，由柳湖间道趋平望，以扼贼路。令汤克宽引舟师从中击之，一战而克，凡斩馘一千九百有奇，焚、溺死者无算，贼气遂馁，岂有一毫怠玩之念。自臣莅任方半年，前后俘斩以五千计，惟是智略浅短，不能俄顷扫荡，此则臣罪不报。刑部尚书何鳌，竟论克宽与经罪死，系狱待决。
八月，倭自南京秣陵关至溧水县杨林桥，典史林文景率兵迎遏，不能御。暑县县丞赵珠臣弃城走，遂由小北门入城，宴饮民家，信宿乃去。
柘林倭贼载舟出海。佥事董邦政、总兵俞大猷等，各督所部水兵，分哨击之，斩首七十有奇，获贼船九艘。邦政复以嘉定兵击贼于宝山，斩首九十八颗。
溧水倭流劫趋宜兴，至岊亭关，闻官兵自太湖出，取道官路桥黄土，越武进境，抵无锡惠山寺，一昼夜奔一百八十里，我兵追及，急击之。贼夜走望亭，次日至浒墅关。苏松巡抚曹邦辅督各官兵围之。南京御史金浙、陶承学，各言中国叛人王直，久住日本，主谋煽祸，乞悬立爵赏，俘馘贼首，及将两京十三省见监并缘事大小武臣许令杀贼赎罪。及公侯勋戚、世臣，有蓄养家丁，行令督率效用。兵部议覆：赏格宜如宣大例，有能擒斩王直来献者，封伯爵，赏银万两，授坐营坐府，职御管事。斩获党酋如明山和尚辈者，授指挥佥事，赏三千两。缘事武臣，本犯仍监候，许令子弟、家丁报效赎罪，充军以擒斩十名颗，永远充军者以二十名颗，死罪者以三十名颗。为勋戚家丁未便，姑已之。诏悉纵部议，第武臣犯死罪者，不准赎。
倭自宜兴奔苏州，会柘林贼为风飘旋者三百余，进据陶宅港。巡抚曹邦辅，虑二贼合且为大患，乃亲督副使王崇古，会集各部兵，扼其东路，四面蹙之。贼逃至五龙，复至海湾山，我兵随地与竞，颇有斩获。太仓卫指挥张大纲被杀，兵卒伤亡甚众。时佥事董邦政、把总娄宇督沙兵守陶宅，邦辅计陶宅贼据险且众，未可进兵，乃召邦政、宇以沙兵助剿，一战斩首十九级，贼始惧，奔吴舍，欲潜走太湖，我兵觉追及于杨林桥，尽歼其众。此贼自绍兴高埠窜走，不过六七十人，流劫杭、严、徽、宁、太平，至犯留都，经行数千里，杀戮及战伤无虑四五千人，凡杀一御史、一县丞、二指挥、二把总，入二县，历八十余日