李栖凤、张天禄皆不应，寻拔营叛；惟左都督刘肇基、副总兵乙邦才、庄子固与楼挺等各引所部至。可法乃率扬州知府任民育、按察佥事王缵爵、监军同知曲从直、江都知县周志畏、权令罗伏龙、参军何刚，又盐运使杨振熙、监饷佥事黄铉、通判吴道正、县丞王志瑞及肇基诸将等，昼夜分陴严守。十八日，降将李遇春持大清豫亲王檄抵城下招可法，可法指遇春数其罪。遇春曰：「公忠义闻华夏，而独不见信于朝，死何益也！何如退选义帝以成名乎」？可法怒，趣发矢射之。须臾，复令乡民持书至，守者引之见；遂挞守者，人与书俱投诸水。豫王愈欲生致之，麾诸军攻姑缓。复遣人贻以书；不启，趣焚之。王知其意坚，攻始急。监军副使高岐凤等踰城降，城中益孤，势不支。越二日，可法乃为书辞其母及妻，呼部将史德威诀曰：「我死当葬我高皇帝侧；不能，梅花岭下可也」。即擐甲上城。豫王复以诏书招之。可法守愈固，相拒七昼夜。大兵四面环击，可法祷诸天，发炮击伤数百人。豫王怒，自督劲卒用巨炮悉力攻城西北隅，崩声如雷；守陴者犹不退，发矢如雨。城下死者山积，大兵翻藉以登，城遂陷。时乙酉四月二十五日也。
先是，可法谓庄子固曰：「城一破，托君剸办之」！子固姑许之。是时，引颈相向，子固弗忍，可法急拔刀自刎。子固与参将许谨共抱持之，血溅满衣袂，未决。复命德威加刃；德威泣，可法骂之。乱兵至，拥之下城，而谨与子固已中飞矢死。一将挟之出小东门，可法大呼曰：「我史阁部也，可见汝兵主」！遂见豫王。王劳之曰：「累以书招而先生不从。今忠义既成，可为我收拾江南，当不惜重任」。可法曰：「我来此，祗索一死耳」！王曰：「君不见洪承畴乎？降则富贵」。曰：「承畴受先帝厚恩而不死，其不忠于后也明矣！我讵肯效其所为」！王乃命将宜尔顿劝之。三日，终不屈，乃杀之。宜尔顿为之殓，未暇识姓名于棺，遂不可辨。肇基等各率将佐巷战移时，格杀千余人，全军尽没，飞矢贯额死；邦才力竭自杀，挺战死城上。其余文武将吏，死者甚众；另有传幕下宾从等之从死者，得十又九人。
扬州既陷五日，史德威报赴南京；举朝震惊，不知所出。又数日，福王出奔太平，京师溃。可法督师几一年，行不张盖、食不重味，夏不箑、冬不裘。小冠窄衣，与部卒相杂处。短小精悍，面黑色，两目烁烁有光；将士见者多慑服。年四十余无子，妻欲为置妾，可法曰：「王事方殷，敢恋儿女私乎」！遂无子。军中值岁除封印，南北文移交至，手自批答。自辰至酉，分给将士月粮。至夜三鼓，谓军吏曰：「今夕，除夕也。索酒试饮」。酒未至，复呼曰：「礼贤馆诸秀才当共饮。顾夜已半，可赍酒资分馈之」。吏往，独酌；庖人报日中飨士肉已尽，乃索盐豉下之。可法素善饮，数斗不乱；军兴以来，竟绝饮。不解衣就寝者，已七阅月。当夕满酌数十杯；思及先帝，泫然泪下。酒微醺，隐几卧。将旦，有司吏士咸集军门外，门未启；军吏遥谓曰：「相公方隐几奈何」？知府任民育曰：「噫，相公此夕不易得也，勿惊之」！且戒鼓人更击四鼓。可法寤，天已曙，大惊；闻鼓声怒曰：「乃敢乱我军法」！传令缚至，趣斩之。诸将士皆长跪言：「相公久劳苦，始得一夕暇，不忍相惊；故乱鼓声以待。此知府意也」。可法意解。亟具盥漱，启门，文武臣皆北向贺，将吏上谒。民育更前请罪；可法曰：「公固爱我，奈何以私爱变常法」！乃赦鼓人。然自是不复隐几卧矣。后军事益冗，以监军郎中黄日芳才敏练，留之左右；辞曰：「日芳老矣，岂能久侍，公亦宜节劳。发书走檄，僚士优为；征兵问饷，有司专责：何必昼夜损神，躬亲庶务乎！且兵，杀机也，当以乐意行之；将，死官也，须以生气出之：汾阳所以生色满前也」。可法笑不答。
初以定策功，加少保兼太子太保；太后至，加少傅兼太子太傅；叙江北战功，加少兼师太子太师；徐州擒盗功，加太傅：皆力辞，不许。后以宫殿成，加太师；又辞，许之。既死后，四方弄兵者念其遗烈，多假其名号以行，故时谓可法不死。部将史德威奉遗命为子，乃具衣冠招魂葬于梅花岭下。闽中立国，首赠太师，谥「忠靖」。
弟可程，崇祯癸未进士，选庶吉士。京师陷，不能死；贼去，南归。可法请下吏；朝廷以可法故，令家居养母。后流寓金陵，阅四十年而卒。
「勘本」曰：阁辅史忠正公殉节后，或有诬之者曰：公如姚平仲故事，跨白骡去。或曰：缒城走，目沉诸江。或曰：城破，执至大营，留三日，不屈杀之（温氏从此）。杨氏跋语云：「皆非也。事实得杨遇蕃、安珠护、史德威之所述而后知公之授命，即于城破之日也。杨遇蕃，凤阳人，向依幕下。扬州破，公自刭未遂，乱兵拥至西城上见大帅。帅询之，公曰：「我史阁部也」。时，遇蕃被擒，令辨之。报曰：「确」。帅乃劝公降，公怒。遇蕃亦言「愿忍须臾死，以救百姓」。公叱曰：「若父一教官权令事而能死节；我独何？我今日一死外，遑恤其它」！声愈厉。帅起拔刀将砍之，公挺立，首迎其刃。帅退，叠呼「好男子」不置。左右杀之，支解之