镇对调，仍归总督管辖」等语。即着杨昌浚、刘铭传会同筹议具奏。闽、台防务，关系紧要；该督等商办一切，务当和衷共济、不分畛域，力顾大局。上年谕令该督等会议台湾改设事宜，并着一切妥议，毋稍迟延』。
——见光绪朝「东华续录」卷七十五（光绪七十五）。
夏五月庚子（初八日），谕：『刘铭传奏「各路生番归化，请将开山恳抚尤为出力官绅恳恩给奖」一折，上年冬间台湾生番滋事，经刘铭传督率官军分路剿办并派员赴各社反复开导，该番等慑于兵威，率众就抚，现已招抚四百余社、归化七万余人，办理尚为妥速。刘铭传调度有方，深堪嘉尚！刘朝佑、章高元随同办理剿抚事宜，颇为得力；该二员均着交部从优议叙。其余出力员弁官绅不无微劳足录，自应量予奖励。道员林朝栋，着赏给「劲勇」巴图鲁名号，并加三品衔；总兵刘泰和，着赏给「健勇」巴图鲁名号；唐仁闿，着以提督交军机处记名，并遇有总兵缺出先行请旨简放；提督尤福聚，着赏给一品封典；参将张广居，着免补参将以副将仍留原省尽先补用；典史陆陈谦，着以县丞仍留福建补用；武举黄希文，着以守备补用；军功陈森吴，着赏给五品蓝翎。另片奏「前藩司沈宝奎赞助抚番、筹划经费，异常出力；请谕格施恩」等语。沈宝奎，着赏还原衔、花翎。余着照所议办理。该部知道』。
——见光绪朝「东华续录」卷七十六（光绪七十六）。
秋七月甲辰（十三日），杨昌浚等奏：『光绪十一年九月初五日钦奉慈禧端佑康颐昭豫庄诚皇太后懿旨：「醇亲王奕譞等「遵筹海防善后事宜」折内奏称台湾要区，宜有大员驻扎等语。台湾为南洋门户，关系紧要；自应因时变通，以资控制。着将福建巡抚改为台湾巡抚，常川驻扎；福建巡抚事，即着闽浙总督兼管。所有一切改设事宜，该督、抚详细筹议，奏明办理。钦此」。又于十一年十月十九日奉上谕：「台湾南北地舆，袤延甚远；以形势而论，台北各海口尤为紧要。原设台湾道一员远驻台南，深虑难以兼顾；且巡抚常川驻扎，一切钱榖、刑名事宜，必须分员管理，各专责成。应否于台湾道之外添设台北道一员？着杨昌浚、刘铭传悉心会商，妥议具奏」等因，钦此。钦遵经臣等各将筹度情形先后覆奏。十一年十二月十二日奉上谕：「杨昌浚所奏「添设台北道不如添设藩司」，系为因地制宜起见；自可准行。台湾虽设行省，必须与福建连成一气，如甘肃、新疆之制，庶可内外相维。着详细会商，奏明办理」。复于十二年三月二十四日奉上谕：「刘铭传奏：澎湖为闽、台门户，非特设重镇不足以资守制。杨昌浚与该抚意见相同：拟将澎湖副将与海坛镇对调，仍归总督管辖等语。即着杨昌浚、刘铭传会同筹议具奏。闽、台防务，关系紧要；该督等商办一切，务当和衷共济、不分畛域，力顾大局。上年谕令该督等会议台湾改设各事宜，并着一并妥议，毋稍延迟」等因，钦此。仰见皇太后、皇上垂念海疆谆谆训诫之至意。臣等忝膺重寄、目击时艰，何敢不竭力筹维，和衷商榷！以期事归尽善，仰纾宸廑。除往返函牍不计外，臣昌浚于二月间渡台、臣铭传四月间复内渡，详细面商；查台湾为南洋门户、七省藩篱，奉旨改设巡抚以资控制，实为保固海疆远大之谋。惟沿海数县之地，其余番地尚系化外，气局未成；孤悬海外，与新疆情形不同。闽、台本系一省，今分而为二，尤须唇齿相依，以收指臂之助；诚应遵旨「内外相维、不分畛域」，乃可于事有成。兹就省局司道署台湾道陈鸣志、总理粮台前贵州藩司沈应奎筹议各条，覆加酌核；谨缮清单，恭呈御览。现在整顿海防，百废待举。加以改设行省，经费浩繁；如澎湖一岛办防需银八十万两，业经臣等先后奏请敕部指拨。此外办防制械设电、添官分治、招垦抚番，在在均关紧要。至建立省城、衙署、坛庙各项工程虽不妨稍缓，惟既经分省，亦不能不次第举办。台北防营除裁撤外，尚存三十五营；分防沿海二千余里，势难再减。臣等悉心筹划，拟由闽海关本年照旧协银二十万两；经臣铭传咨请福州将军古尼音布：嗣后由厦关经拨解台。其闽省各库局，无论如何为难，每年按限协银二十四万两，陆续筹解；并请旨饬下粤海、江海、浙海、九江、江汉五关每年协银三十六万两，共成八十万两，以五年为度。统计闽省及闽海关所协四十四万合之台内岁入百万两，专为防军月饷之需。其五关每岁各协银七万余两，尚属轻而易举；而台事稍得藉手，庶不致尽托空言。仍求朝廷宽以时日，容臣铭传分别缓急轻重，次第举办。现已奏明清理田赋并随地随事力求整饬，变私为公。如三、五年后能照部议「以台地自有之财供台地之用」，即当奏请停止协款。一切改设事宜，清单内有未赅载者，容臣等续行奏咨办理」。上谕：『杨昌浚、刘铭传奏「遵议台湾改设行省事宜开单呈览」一折，着该部议奏。单并发』。
——见光绪朝「东华续录」卷七十七（光绪七十七）。
九月乙未（初五日），谕：『刘铭传奏「提镇大员克扣饷银，请旨革职降补」等语。记名提督方春发统带镇海前军三营，于营中应发各项饷