迅速攻克，得以并力南下。该逆势不能支，图窜遂昌、松阳以为牵掣我军之计，实在意中。着该督严饬曾元福等分投防范，毋稍松懈。斗六失陷情形，前据徐宗干奏报，已严谕设法进剿；可见在事将弁，前报贼党穷蹙各情，全不足信。见经耆龄派令关镇国等管带师船并添派陆兵三百名前往，是否足敷剿办？斗六地处紧要，密迩台郡，断不可任其日久迁延。曾元福见虽未能抽调，仍着该督察看军情，妥为调度，并严饬在台各将弁迅图肃清；如有不得力者，从严参办。恐该郡孤悬海外，该将弁等恃督、抚不能觉察，肆意欺饰；耆龄务当留心察访，会同徐宗干随时整饬，以期克日荡平。署金门左营守备黄炳南派令管带师船，中途折回，实属不知缓急；且难保无畏葸不前，藉词逗留情事。着先行革职，解省交耆龄、徐宗干严行审讯；如有捏词延玩等情，即行从严参办。秦如虎见未销假，惟宁波防务紧要，着即催令克期就道，驰赴宁郡接署提督印务；毋得稍涉迁延，致干咎戾。将此由六百里各谕令知之』。
乙亥（二十七日），谕：『徐宗干奏「调集内地官兵渡台分剿」并「台湾道洪毓琛历陈彰化逆匪情形」各一折，逆首戴万生自攻陷斗六门后，进逼嘉义，台湾郡城亦岌岌可危；曾玉明见顾北路、保守鹿港，未能分军援嘉。该抚见委吴鸿源暂署水师提督，藉壮声威；着即饬该署提督督率各军奋力兜捕，先将嘉义近城贼寨扫荡，克复斗六、进规彰化，以期与曾玉明合力会剿，肃清台境。耆龄远在浦城，鞭长莫及，该抚责无旁贷；务当振刷精神，严饬派出各军实力剿办，并督饬洪毓琛就近激励将士迅扫妖氛，不得贻误，致干咎戾。林向荣及斗六军营文武下落，迅速查明具奏。将此由六百里谕知徐宗干，并传谕洪毓琛知之』。
——以上见同治朝「东华续录」卷十六（同治十六）。
十二月丁酉（二十日），谕：『洪毓琛奏「斗六失陷、嘉义吃紧，见办情形」一折，斗六为嘉、彰联界之所，既已失陷、非力固嘉义，则郡城岌岌可危，所关非轻。前据徐宗干奏：「已饬吴鸿源统带各军渡台，援助嘉义；曾玉明一军保守鹿港，专顾北路」。惟此时嘉义尤形吃紧，且郡城精锐兵勇悉皆调归林向荣部下，自败挫后兵勇散亡；刻下援嘉之师，非厚集兵力，不足扫荡逆氛。曾玉明素习战阵，着即迅饬该总兵督率所部，节节进剿；并迅催吴鸿源统带诸军前进，会合夹击，保全嘉义、进攻彰化，肃清台境，毋许稽延时日。逆党林戆成踞守彰城，欲牵掣曾玉明兵勇，则鹿港亦须兼顾；并着饬令该总兵等分拨兵勇，严为扼剿。该督等务当振刷精神，严饬各军速歼逆氛，不得稍有贻误；致令匪势蔓延，自干咎戾。洪毓琛近在郡城，一切守御事宜及各营派兵筹饷，尤宜悉心筹办。此时斗六既陷、彰化未复，道路恐致中阻；所需粮饷、军火，仍着设法由海道运往接济。将此由六百里谕知耆龄、徐宗干，并传谕〔洪〕毓琛知之』。
复福建阵亡已革总兵官林向荣职，并副将王国忠等均予祭葬、世职。
癸卯（二十六日），命薛焕来京，以江苏巡抚李鸿章暂署办理通商事务钦差大臣。
丁未（三十日），谕：『耆龄奏「贼援汤溪，迎剿获胜」及「催调水陆援师进攻台湾」各折片，汤溪逆匪久已穷蹙，知府康国器率部攻剿，虽因援贼众多，而旷日持久，蕞尔小城尚未攻拔；其剿办未能得力，已可概见，且闻有纵勇滋优各情。见在该督添募南康勇三千名前往助剿，即着严饬在事员弁迅速攻拔，毋再迁延。台湾军情，自斗六失陷，贼势愈炽；在事将弁，甚可痛恨！金、厦、铜山征兵既已抵台，吴鸿源等所部岂可任意逗留！着耆龄、徐宗干严催该副将等即日渡台，将斗六先图克复，以解郡城之急，再行节节进剿！毋得徒托空言。日久无成，必将在事员弁从严惩办，恐该督、抚不能当此重咎也！将此由六百里各谕令知之』。
——以上见同治朝「东华续录」卷十七（同治十七）。
同治二年
同治二年癸亥（一八六三）春正月甲寅（初七日），谕：『洪毓琛奏「郡城防守粗定，见拟先靖近城各路、再剿彰逆」一折，台湾匪徒猖獗，彰城尚被匪踞，嘉义及郡城时形吃紧；必须添兵济饷，方足以资攻剿。前已谕令耆龄、徐宗干迅饬曾玉明、吴鸿源谙军厚集兵力，进功彰化，保全嘉义，肃清台境。着该督速饬该总兵等督率兵勇会合前进，力图扫荡；如兵力不敷，即添拨内地官军迅速渡台，以资剿办。至台湾饷需，并着该督等赶紧设法筹济。洪毓琛见在郡城，一切筹防及饷项事宜，仍着悉心筹办；就见有兵力分投攻剿，不得专待援师，致匪势日形猖獗。将此由五百里谕知耆龄、徐宗干，并谕洪毓琛知之』。
以张铨庆为福建布政使（由记名道迁）。
——以上见同治朝「东华续录」卷十八（同治十八）。
二月丁亥（十一日），谕：『耆龄奏「援师克复永康、武义两县详细情形，并东阳、义乌、浦江等县踞贼逃遁」一折，逆匪盘踞浙东各城，并分股屯聚永康、武义牵掣我军，自攻克