遭风损坏，自请议处」等语。此次损坏船只，即着分别设法修理；沈葆桢未能先事豫防，殊属疏忽！着交部议处。制造轮船工巨费繁，嗣后务当饬令该管驾等随时加慎。又片奏「讯结屯番枪伤生番」一案，即着照所议办理』。
丙寅（二十七日），总理各国事务衙门奏：「切筹海防，将紧要应办事宜撮叙四条，请饬详议』。命各督、抚详细筹议，将逐条切实办法，限于一月内覆奏。
冬十月戊子（十九日），谕军机大臣等：『本日李鹤年奏参「藩司不能称职」一折，据称「福建布政使潘霨由捐纳佐杂出身，心术阴柔、人品卑琐，差委员缺多系捐班人员，以致物议沸腾，编造歌谣黏贴街市；且有袒护同乡，结为朋党及与将军拜认师生各情。近日办理日本事宜，卑词下气，求悦夷人，大失国体」等语。该藩司见在台湾，其办理一切事宜以及平日居官行事，沈葆桢知之必稔；即着按照李鹤年所参各节，秉公详细查明，迅速据实具奏，毋稍徇隐。原折着钞给阅看』。
壬辰（二十三日），谕军机大臣等：『沈葆桢等奏「台湾近日情形并淮军到台」一折，日本兵船尚未退出台湾，刻下退兵章程业经定议，惟此后海防各事宜亟须认真讲求，以期有备无患。现在淮军三起均抵澎湖，应如何分扎要隘之处？仍着沈葆桢等酌度情形，妥为布置。其南、北开路以及郡城修筑炮垒各事，并着该大臣等悉心经理，毋稍松劲。刺桐脚庄民已与龟纹社释嫌寻好，琅■〈穴上弘下〉诸社均受约束，其余亟须次第清查；惟入山愈深，番社愈杂，北路复有生番扑犯碉楼、伤毙兵丁之事，亟应妥为筹办，俾番众悉为我用，藉可自固藩篱。着沈葆桢、文煜、李鹤年、王凯泰、潘霨饬令派出各员设法招徕，随时抚恤。招垦事宜，仍须商同罗大春认真筹划。台郡城工业已过半，安平炮台见拟设于三鲲身地方；一切工程，沈葆桢等务当悉心经画，毋得畏难思阻』。
丁酉（二十八日），谕军机大臣等：『大学士文祥奏「敬陈管见」一折，台湾之事权宜办结，亟宜未雨绸缪，岂可仍蹈因循锢习。着沈葆桢、文煜、李鹤年、王凯泰、潘霨悉心筹商：所有在台兵勇应如何酌留？淮军素称得力，见在业已到台，应如何分扎防堵？全台事宜，应如何布置？该大臣等务当妥为经画，以善将来，并着李鸿章、李宗羲将前议购买未成之铁甲船、水炮台及应用军械等件，迅速筹款购办；庶几兵械精良，有备无患。原折着钞给阅看』。
十一月壬子（十三日），谕军机大臣等：『沈葆桢等奏「日本遵约退兵，收回草房营地」一折，日本兵船尽数退出台湾，其遗下营房草房板片，均经点收完竣，该处已派官军填扎；惟琅■〈穴上弘下〉一带善后机宜，亟须悉心筹划、妥善经营。所有招抚生番及修城、开路各事宜，仍当妥筹办理；毋得以倭兵已退，即形松懈。着沈葆桢、文煜、李鹤年、王凯泰、潘霨懔遵十月二十八日谕旨，妥为布置，毋稍因循。沈葆桢等惟当于此时力图自强之策，以期未雨绸缪，庶几有备无患。另片奏「道员黎兆棠因病回籍」等语。该员见经简放津海关道，即着沈葆桢传知黎兆棠病痊后迅速赴任，以重职守』。
——以上见同治朝「东华续录」卷一百（同治一百）。