邹守益《道南三书》三卷，《明道录》四卷
何瑭《柏斋三书》四卷
薛蕙《日录》五卷
顾应祥《惜阴录》十二卷
沈霁《语录》四卷
邵经邦《弘道录》五十七卷
唐顺之《儒编》六十卷
薛应旂《考亭渊源录》二十四卷，《薛子庸语》十卷
王艮《心斋语录》二卷
周思兼《学道记言》六卷
胡直《胡子衡齐》八卷
陆树声《汲古丛语》一卷
金贲亨《道南录》五卷，《台学源流集》七卷
尤时熙《拟学小记》八卷
刘元卿《诸儒学案》八卷
周琦《东溪日谈》十八卷
罗汝芳《明道录》八卷，《近溪集语》十二卷
耿定向《庸言》二卷，《雅言》一卷，《新语》一卷，《教学商求》一卷
李渭《先行录》十卷
王樵《劄记》一卷，《笔记》一卷
许孚远《语要》二卷
硃衡《道南源委录》十二卷
孙应鰲《论学汇编》八卷
梁斗辉《圣学正宗》二十卷
管志道《问辨牍》八卷，《理学酬咨录》八卷
王敬臣《俟后编》四卷
吕坤《呻吟语》四卷
邹德溥《畏圣录》二卷
邓球《理学宗旨》二卷
李材《教学录》十二卷，《南中问辨录》十卷
曾朝节《臆言》八卷
邹元标《仁文会语》四卷，《日新编》二卷
杨起元《证学编》二卷，《识仁编》二卷
徐即登《儒学明宗录》二十五卷
黄时熠《知非录》六卷
钱一本《黾记》四卷
顾宪成《劄记》十八卷，《东林商语》二卷，《证性编》八卷，《当下绎》一卷，《泾阳遗书》二十卷
李多见《学原前后编》八卷
涂宗浚《证学记》三卷
周子义《日录见闻》十卷
吴仕期《大儒敷言》三十三卷
徐三重《信古余论》八卷
来知德《日录》十二卷
方学渐《心学宗》四卷
姚舜牧《性理指归》二十八卷
冯从吾《元儒考略》四卷，《语录》六卷
唐鹤徵《宪世编》六卷
曾凤仪《明儒见道编》二卷
周汝登《圣学宗传》十八卷
高攀龙《就正录》二卷，《高子遗书》十二卷
孙慎行《困思抄》四卷
刘宗周《理学宗要》一卷，《证人要旨》一卷，《刘子遗书》四卷
叶秉敬《读书录钞》八卷
黄道周《榕坛问业》十八卷
章世纯《留书》十卷
黄淳耀《吾师录》一卷，《语录》一卷，《劄记》二卷
──右儒家类，一百四十部，一千二百三十卷。
太祖《资治通训》一卷，凡十四章，首君道，次臣道，又次民用、士用、工用、商用，皆著劝导之意。《公子书》一卷，训世臣。《务农技艺商贾书》一卷训庶民子弟。
成祖《务本之训》一卷采太祖创业事迹及往古兴亡得失为书，以训太孙
仁孝皇后《劝善书》二十卷
宋濂《燕书》一卷
王廉《迂论》十卷
叶子奇《草木子》八卷
王达《笔畴》二卷
曹安《谰言长语》二卷
赵弼《事物纪原删定》二十卷
解延年《物类集说》三十四卷
罗颀《梅山丛书》二百卷，《物原》二卷
谢理《东岑子》四卷
潘府《南山素言》一卷
何孟春《余冬序录》六十五卷，《闲日分义》一百卷
戴鱀《经济考略》二十卷
戴璟《博物策会》十七卷
陆深《同异录》一卷，《传疑录》二卷
孙宜《遁言》二卷
祝允明《前闻记》一卷，《读书笔记》一卷
蔡羽《太薮外史》五卷
刘绘《刘子通论》十卷
高岱《楚汉余谈》一卷
罗虞臣《原子》八卷
王杰《经济总论》十卷
汪坦《日知录》五卷
刘凤《刘子杂组》十卷
王世贞《劄记》二卷，《宛委余编》十九卷
王可大《国宪家猷》五十六卷万历中，御史言内阁丝纶簿猝无可考，惟是书载之。遂取以进。
沈津《百家类纂》四十卷
陈耀文《学圃萱苏》六卷，《学林就正》四卷
陈绛《金罍子》四十四卷
方弘静《千一录》二十六卷
劳堪《史编始事》二卷
陈其力《芸心识余》八卷
周祈《名义考》十二卷
詹景凤《詹氏小辨》六十四卷
穆希文《说原》十六卷，《动植记原》四卷
王三聘《事物考》八卷
徐常吉《诸家要旨》二卷
徐伯龄《蟫精隽》二十卷
赵士登《省身至言》十卷
刘仕义《知新录》二十四卷