起修則全性成修性無所移修常宛爾修又二種順修逆修順謂了性為行逆謂背性成迷迷了二心心雖不二逆順二性性事恒殊可由事不移心則令迷修成了故須一期迷了照性成修見性修心二修俱泯又曉順修對性有離有合離謂修性各三合謂修二性一修二各三共發性三是則修雖具九九祇是三為對性明修故合修為二二與一性如水為波二亦無二亦如波水應知性指三障是故具三修從性成成三法爾達無修性唯一妙乘無所分別法界洞朗此申內外不二門成 四因果不二門者眾生心因既具三軌此因成果名三涅槃因果無殊始終理一若爾因德已具何不住因但由迷因各自謂實若了迷性實唯住因故久研此因因顯名果只緣因果理一用此一理為因理顯無復果名豈可仍存因號因果既泯理性自亡祇由亡智親疎致使迷成厚薄迷厚薄故強分三惑義開六即名智淺深故如夢勤加功空名惑絕幻因既滿鏡像果圓空像雖即義同而空虗像實像實故稱理本有空虗故迷轉性成是則不二而二立因果殊二而不二始終體一若謂因異果因亦非因曉果從因因方克果所以三千在理同名無明三千果成咸稱常樂三千無改無明即明三身並常俱體俱用此以修性不二門成。
  五染淨不二門者若識無始即法性為無明故可了今即無明為法性法性之無明徧造諸法名之為染無明之法性偏應眾緣號之為淨濁水清水波浮無殊清濁雖即由緣而濁成本有濁雖本有而全體是清以二波理通舉體是用故三千因果俱名緣起迷悟緣起不離剎那剎那情常緣起理一一理之內而分淨穢別則六穢四淨通則十通淨穢故知剎那染體悉淨三千未顯驗體仍迷故相似位六根徧照分十界各具灼然豈六根淨人謂十定十分真垂迹十界亦然乃由果成等彼百界故須初心而遮而照照故三千恒具遮故法爾空中終日雙亡終日雙照不動此念徧應無方隨感而施淨穢斯泯亡淨穢故以空以中仍由空中轉染為淨由了染淨空中自亡此以因果不二門成 六依正不二門者已證遮那一體不二良由無始一念三千以三千中生陰二法為正國土一千屬依依正既居一心一心豈分能所雖無能所依正宛然是則理性名字二行已有不二依正之相故使自佗因果相攝但眾生在理果雖未辨一切莫非遮那妙境然應復了諸佛法體非偏而偏眾生理性非局而局始終不改大小無妨因果理同依正何別故淨穢之土勝劣之身塵身與法身量同塵國與寂光無異是則一一塵剎一切剎一一塵身一切身廣狡勝劣難思議淨穢方所無窮盡若非三千空假中安能成茲自在用如是方知生佛等彼此事理互相収此以染淨不二門成 七自他不二門者隨機利佗事乃憑本本謂一性具足自他方至果位自即益佗如理性三德三諦三千自行唯在空中利他三千赴物物機無量不出三千能應雖多不出十界十界轉現不出一念身土互生不出寂光眾生由理具三千故能感諸佛由三千理滿故能應應偏機偏欣赴不差不然豈能如鏡現像鏡有現像之理形有生像之性若一形對不能現像則鏡理有窮形事未通若與鏡隔則容有是理無有形體而不像者若鏡未現像由塵所遮去塵由人磨像現非關磨者以喻觀法大旨可知應知理雖自佗具足必藉緣了為利佗功復由緣了與性一合方能稱性施設萬端則不起自性應無方所此由依正不二門成 八三業不二門者於化他門自分三密隨順物理得名不同心輪鑒機二輪設化現身說法未曾毫差在身分於真應在法分於權實二身若異何故乃云即是法身二說若乖何故乃云皆成佛道若唯法身應無垂世若唯佛道誰施三乘身尚無身說必非說身口平等等彼意輪心色一如不謀而化常冥至極稱物施為豈非百界一念界界無非三業界尚一念三業豈殊果用無虧因必稱果若信方知三密有本百界三業俱空假中故使稱宜偏赴為果一一應色一一言音無不百界三業自具足化復作化斯之謂歟故一念凡心已有理性三密相海一塵報色同在本理毗盧遮那方乃名為三無差別此以自佗不二門成。
  九權實不二門者平等大慧常鑑法界亦由理性九權一實實復九界權亦復然權實相冥百界一念不可分別任運常然至果乃由契本一理非權非實而權而實此即如前心輪自在致令身口赴權實機三業一念無乖權實不動而施豈應隔異對說即以權實立稱在身即以真應為名三業理同權實冥合此以三業不二門成 十受潤不二門者物理本來性具權實無始熏習或實或權權實由熏理恒平等遇時成習行願所資若無本因薰亦徒設遇薰自異非由性殊性雖無殊必籍幻發幻機幻感幻應幻赴能應所化並非權實然由生具非權非實成權實機佛亦果具非權非實為權實應物機契應身土無偏同常寂光無非法界故知三千同在心地與佛心地三千不殊四微體同權實益等此以權實不二門成。
  是故十門十門通入色心乃至受潤咸然故使十妙始終理一始境本具三依理生解故名為智智解導行行解契理三法相符不異而假立淺深設位簡濫法祇是證彼理三下之五章三法起用三法既是一念三千即空假中成故有用若了一念十方三世諸佛之法本迹非遙故重述十門令觀行可識首題既爾覽別為總符文可知。

  法華十妙不二門示珠指卷上
  法華十妙不二門示珠指卷下

  入文大分三初總敘一期不二宗旨二別立十門歷法解釋三融通文旨結意歸宗(初文分三初結示前章教觀宗要又二初略示教觀旁正又二初教正故意周又二初述所談之本意)然者是也生前起後之辭此者指定迹門也迹謂影迹諸佛出世化事未顯本之前